RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 SOX5P35711 763 aa27.89■■■□□ 2.06
CCZ1B-211ENST00000486840 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
CCZ1B-211ENST00000486840 MESP2Q0VG99 397 aa27.89■■■□□ 2.06
CCZ1B-211ENST00000486840 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
CCZ1B-211ENST00000486840 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa27.89■■■□□ 2.06
CCZ1B-211ENST00000486840 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa27.89■■■□□ 2.06
CCZ1B-211ENST00000486840 C18orf8Q96DM3 657 aa27.89■■■□□ 2.06
CCZ1B-211ENST00000486840 GANQ9H2C0 597 aa27.89■■■□□ 2.06
CCZ1B-211ENST00000486840 TJP2Q9UDY2 1190 aa27.89■■■□□ 2.06
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa27.89■■■□□ 2.06
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CCZ1B-211ENST00000486840 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa27.88■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF18P17022 549 aa27.88■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 ABCB4P21439 1286 aa27.88■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 KLK7P49862 253 aa27.88■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC6A3Q01959 620 aa27.88■■■□□ 2.05
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CCZ1B-211ENST00000486840 SYPL2Q5VXT5 272 aa27.88■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa27.88■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa27.88■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 TAC4Q86UU9 113 aa27.88■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 C11orf74Q86VG3 221 aa27.88■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 SFTPA1Q8IWL2 248 aa27.88■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM217AQ8IXS0 508 aa27.88■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 COX16Q9P0S2 106 aa27.88■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 STOML2Q9UJZ1 356 aa27.88■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 MYOFQ9NZM1 2061 aa27.88■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 SYCE3A1L190 88 aa27.87■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 SGK1O00141 431 aa27.87■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 NPC1O15118 1278 aa27.87■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 TIMM44O43615 452 aa27.87■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 FYNP06241 537 aa27.87■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 HOXB2P14652 356 aa27.87■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
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CCZ1B-211ENST00000486840 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 DEFB106AQ8N104 65 aa27.87■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 CIPCQ9C0C6 399 aa27.87■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 DDIT4Q9NX09 232 aa27.87■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 RRN3Q9NYV6 651 aa27.87■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 FBXO10Q9UK96 956 aa27.87■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 STAP1Q9ULZ2 295 aa27.87■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 GRAP2O75791 330 aa27.86■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 SERPINC1P01008 464 aa27.86■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 IGLV3-27P01718 113 aa27.86■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 ERBB2P04626 1255 aa27.86■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 CISD3P0C7P0 127 aa27.86■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 STARD3Q14849 445 aa27.86■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
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CCZ1B-211ENST00000486840 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
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CCZ1B-211ENST00000486840 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa27.86■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM51Q9NW97 253 aa27.86■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 SIK3Q9Y2K2 1263 aa27.86■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 TBL1XO60907 577 aa27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 CAVIN2O95810 425 aa27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 CCR1P32246 355 aa27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 WASP42768 502 aa27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 TAF5Q15542 800 aa27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 PTPN20Q4JDL3 420 aa27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 MPP7Q5T2T1 576 aa27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 EPS8L1Q8TE68 723 aa27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 HMGB4Q8WW32 186 aa27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 BTN2A3PQ96KV6 586 aa27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 SPACA7Q96KW9 195 aa27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 STIM2Q9P246 746 aa27.85■■■□□ 2.05
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CCZ1B-211ENST00000486840 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa27.85■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 PRRT4C9JH25 899 aa27.84■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 MAP3K13O43283 966 aa27.84■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 RHOBTB1O94844 696 aa27.84■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 RETP07949 1114 aa27.84■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 MMEP08473 750 aa27.84■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP1A3P13637 1013 aa27.84■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 NOS2P35228 1153 aa27.84■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 CDR2Q01850 454 aa27.84■■■□□ 2.05
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CCZ1B-211ENST00000486840 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 PIK3R6Q5UE93 754 aa27.84■■■□□ 2.05
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CCZ1B-211ENST00000486840 TRIM72Q6ZMU5 477 aa27.84■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC26A9Q7LBE3 791 aa27.84■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa27.84■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC2A13Q96QE2 648 aa27.84■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 TPSD1Q9BZJ3 242 aa27.84■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP27.84■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa27.83■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 GFRA2O00451 464 aa27.83■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
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