RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486667.5

SRSF11-215, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 11, human

TSL 5

Gene SRSF11, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRSF11-215	ENST00000486667	FGF18	O76093	207 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	FAM153B	P0C7A2	387 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	CSH1	P0DML2	217 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	CSH2	P0DML3	217 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	GOT1	P17174	413 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	ATF6	P18850	670 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	ADCY8	P40145	1251 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	PGF	P49763	221 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	TAF10	Q12962	218 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	MTMR3	Q13615	1198 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	FAM153C	Q494X1	144 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	RASIP1	Q5U651	963 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	ALS2CL	Q60I27	953 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	C4orf22	Q6V702	233 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	RFX8	Q6ZV50	586 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	ADAM32	Q8TC27	787 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	CASP10	Q92851	521 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	RTP4	Q96DX8	246 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	SLC39A13	Q96H72	371 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	C1orf74	Q96LT6	269 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	EPAS1	Q99814	870 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	ZBP1	Q9H171	429 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	USP29	Q9HBJ7	922 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	OSER1	Q9NX31	292 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	COX16	Q9P0S2	106 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	GMIP	Q9P107	970 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	NUP205	Q92621	2012 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	OBSL1	O75147	1896 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667		I6L893	689 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	SGK1	O00141	431 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	C2CD2L	O14523	706 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	DCLK1	O15075	740 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	PPFIA2	O75334	1257 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	SOAT2	O75908	522 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	SEC24A	O95486	1093 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	C1R	P00736	705 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	RARG	P13631	454 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	AMPD1	P23109	780 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	ALDH1A3	P47895	512 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	PPP3CC	P48454	512 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	PLTP	P55058	493 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	RING1	Q06587	406 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	SLMAP	Q14BN4	828 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	RTL10	Q7L3V2	364 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	PCGF5	Q86SE9	256 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	IQCK	Q8N0W5	287 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	RNF34	Q969K3	372 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	OLFM3	Q96PB7	478 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	OGFR	Q9NZT2	677 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	IRAK3	Q9Y616	596 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	FAM72C	H0Y354	149 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667		H7C0C1	242 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	NCAM2	O15394	837 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SRSF11-215	ENST00000486667	IGLV3-27	P01718	113 aa		10.61	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms