RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-209	ENST00000486016	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	AREL1	O15033	823 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	YY1	P25490	414 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	VPS41	P49754	854 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	PGGT1B	P53609	377 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	PGM5	Q15124	567 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	PHKB	Q93100	1093 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	TSPAN6	O43657	245 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	UGDH	O60701	494 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	SGPL1	O95470	568 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	WNT1	P04628	370 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	MATN1	P21941	496 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	P2RX3	P56373	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ZXDB	P98169	803 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	DMWD	Q09019	674 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016		M0QZQ0	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	NGFR	P08138	427 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	MST1	P26927	711 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC5A2	P31639	672 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	STAT6	P42226	847 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	AGTR2	P50052	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	DAG1	Q14118	895 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	DHH	O43323	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	DRD1	P21728	446 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	GPS1	Q13098	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	PTGR1	Q14914	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	EME1	Q96AY2	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016		A6NNC1	897 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	THAP12	O43422	761 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	MMP8	P22894	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	PPAT	Q06203	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ELF2	Q15723	593 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	GDF15	Q99988	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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