RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479155.1

LLGL1-202, Transcript of LLGL1, scribble cell polarity complex component, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LLGL1, Length 6,004 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL1-202ENST00000479155 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 CCDC153Q494R4 210 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 MTERF3Q96E29 417 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 RERGLQ9H628 205 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 USP32Q8NFA0 1604 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 ALDH9A1P49189 494 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 NCF4Q15080 339 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 AGKQ53H12 422 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 FAM83AQ86UY5 434 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 CCDC103Q8IW40 242 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 SERPINB11Q96P15 392 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 CATSPER2Q96P56 530 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 COMMD8Q9NX08 183 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 TMEM114B3SHH9 223 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 AXLP30530 894 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 SLC1A6P48664 564 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 CORO7P57737 925 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 PTENP60484 403 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 TBL1YQ9BQ87 522 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 PIF1Q9H611 641 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 KATNA1O75449 491 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 FYNP06241 537 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 FCGR1AP12314 374 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 NUP107P57740 925 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 HTR3CQ8WXA8 447 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 AKT1S1Q96B36 256 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 TBCBQ99426 244 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.8□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 RAD51BO15315 384 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 KRT6AP02538 564 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 KRT6BP04259 564 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 SCTRP47872 440 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 KRT6CP48668 564 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 VAC14Q08AM6 782 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 TLK2Q86UE8 772 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 PHF21BQ96EK2 531 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 MTFR1LQ9H019 292 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 PARVBQ9HBI1 364 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 INTS13Q9NVM9 706 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 LACTBL1A8MY62 500 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 SGCGQ13326 291 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 DPY30Q9C005 99 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 VTA1Q9NP79 307 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 AHSPQ9NZD4 102 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 SLC5A5Q92911 643 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 TMEM159Q96B96 161 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 RGS18Q9NS28 235 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 MGAT1P26572 445 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 YWHAQP27348 245 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 ZNF410Q86VK4 478 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 CPNE1Q99829 537 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 ITSN1Q15811 1721 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 RIPK2O43353 540 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 GHRP10912 638 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 PTPN3P26045 913 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 PPP2R1BP30154 601 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 MLH1P40692 756 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 NR2C2P49116 596 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 NPY2RP49146 381 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 RARRES1P49788 294 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 OAZ1P54368 228 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 ADRM1Q16186 407 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.79□□□□□ -0.04
LLGL1-202ENST00000479155 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms