RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473447.1

BUD31-208, Transcript of BUD31 homolog, human

TSL 2

Gene BUD31, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BUD31-208	ENST00000473447	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BUD31-208	ENST00000473447	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	MGA	Q8IWI9	3026 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	UBE4B	O95155	1302 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	ATM	Q13315	3056 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	SPTLC2	O15270	562 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	STX6	O43752	255 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	PCDHGA12	O60330	932 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	SEMA4F	O95754	770 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	CYBB	P04839	570 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	CASP1	P29466	404 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	CHKA	P35790	457 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	DNAJC3	Q13217	504 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	INAVA	Q3KP66	663 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	DDI1	Q8WTU0	396 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	TWNK	Q96RR1	684 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	AK5	Q9Y6K8	562 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	MAST4	O15021	2626 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	TK2	O00142	265 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	RALA	P11233	206 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	P4HA1	P13674	534 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	JUP	P14923	745 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	HNF1B	P35680	557 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	CTSK	P43235	329 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	ASPA	P45381	313 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	DLG4	P78352	724 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	ZNF843	Q8N446	348 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447		E9PAM4	449 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	ENC1	O14682	589 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	TSPAN3	O60637	253 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	PPP6R2	O75170	966 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	CD27	P26842	260 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	PIK3CA	P42336	1068 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	KIF11	P52732	1056 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	C21orf59	P57076	290 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	HES3	Q5TGS1	186 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	ZNF605	Q86T29	641 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	UNC93A	Q86WB7	457 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	SLC6A18	Q96N87	628 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	DCLK3	Q9C098	648 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447		A0A1B0GTQ1	180 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	SLC12A8	A0AV02	714 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	RFPL3	O75679	317 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	DNTT	P04053	509 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	CD58	P19256	250 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	PSEN1	P49768	467 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	AP3M2	P53677	418 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	BCAT1	P54687	386 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	COG7	P83436	770 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	AMPD3	Q01432	767 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	EHHADH	Q08426	723 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	UNC13D	Q70J99	1090 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	CHST9	Q7L1S5	443 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	GANC	Q8TET4	914 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BUD31-208	ENST00000473447	ARID3A	Q99856	593 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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