RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466247.1

RBM6-215, Transcript of RNA binding motif protein 6, human

TSL 2

Gene RBM6, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM6-215	ENST00000466247	ASNA1	O43681	348 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ITGA5	P08648	1049 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	KLRK1	P26718	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	NR4A2	P43354	598 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	VPS41	P49754	854 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	YPEL5	P62699	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	CFHR1	Q03591	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	BRD3	Q15059	726 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247		A0A087WV62	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	SOCS2	O14508	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	RRH	O14718	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ANXA6	P08133	673 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	PEPD	P12955	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	AKT1	P31749	480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	HTR3A	P46098	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	HSF1	Q00613	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ID2	Q02363	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	CNGA3	Q16281	694 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247		M0QYT0	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	PRY	O14603	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	NPC1	O15118	1278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	FFAR2	O15552	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	DNPH1	O43598	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	NTSR2	O95665	410 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	CER1	O95813	267 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	NPPB	P16860	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	MMP8	P22894	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	DUSP1	P28562	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	THBS4	P35443	961 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	CSHL1	Q14406	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	INPPL1	O15357	1258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	TLR2	O60603	784 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	GLP2R	O95838	553 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	CTSA	P10619	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	GYS1	P13807	737 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	NDUFS1	P28331	727 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	IDUA	P35475	653 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	AGTR2	P50052	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	RHBDL3	P58872	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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