RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	PPP2R5D	Q14738	602 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	MPPE1	Q53F39	396 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	C2orf27A	Q580R0	203 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TRIM24	O15164	1050 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	CACNG3	O60359	315 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	ATG13	O75143	517 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SKIL	P12757	684 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SCNN1A	P37088	669 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	DGKG	P49619	791 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SULT1E1	P49888	294 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	CCR3	P51677	355 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	CENPC	Q03188	943 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	MESP2	Q0VG99	397 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TSSK4	Q6SA08	328 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	IQCD	Q96DY2	449 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SLC39A13	Q96H72	371 aa		18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	18.44	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PQJ5	194 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902		K7EQS6	105 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	CALB1	P05937	261 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SLC2A3	P11169	496 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	ABCB4	P21439	1286 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	CCR1	P32246	355 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	ZBED6	P86452	979 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SATB1	Q01826	763 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	FYB2	Q5VWT5	728 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	RRN3	Q9NYV6	651 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		18.43	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	PRR23A	A6NEV1	266 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	IGLV3-25	P01717	112 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SP9	P0CG40	484 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SLC6A4	P31645	630 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TIE1	P35590	1138 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TNFRSF4	P43489	277 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	DEUP1	Q05D60	604 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	EMC1	Q8N766	993 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TERB1	Q8NA31	727 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	AZIN2	Q96A70	460 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TBCB	Q99426	244 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	STIM2	Q9P246	746 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		18.42	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TBL1X	O60907	577 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	GJB6	O95452	261 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	GYPC	P04921	128 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	CASP14	P31944	242 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	FLT3	P36888	993 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	PRKCI	P41743	596 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	PTP4A2	Q12974	167 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	EMC10	Q5UCC4	262 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	CHSY1	Q86X52	802 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		18.41	■□□□□ 0.54
USP19-210	ENST00000465902	P2RY11	Q96G91	374 aa		18.41	■□□□□ 0.54

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