RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 IRX4P78413 519 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 USP49Q70CQ1 688 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 GOLGA1Q92805 767 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 PAGE5Q96GU1 130 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 IFNKQ9P0W0 207 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.31□□□□□ -1.4
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PTPRR-204ENST00000440835 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 PTPRJQ12913 1337 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 H0YHG0 523 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 DCLK1O15075 740 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 TULP3O75386 442 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 LATS1O95835 1130 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRR-204ENST00000440835 HOXB2P14652 356 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 CHKAP35790 457 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRR-204ENST00000440835 SEC13P55735 322 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 ASIC1P78348 528 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRR-204ENST00000440835 STARD3Q14849 445 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF699Q32M78 642 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 FAM71BQ8TC56 605 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 DNASE2BQ8WZ79 361 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRR-204ENST00000440835 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 DMAC2Q9NW81 257 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRR-204ENST00000440835 BIN1O00499 593 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRR-204ENST00000440835 NDUFS2O75306 463 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 RALAP11233 206 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRR-204ENST00000440835 ZXDBP98169 803 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRR-204ENST00000440835 FOXC1Q12948 553 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 CASP8Q14790 479 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC6Q16204 474 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 CPXM2Q8N436 756 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRR-204ENST00000440835 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRR-204ENST00000440835 TCEAL3Q969E4 200 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 MED10Q9BTT4 135 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRR-204ENST00000440835 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 RAB21Q9UL25 225 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRR-204ENST00000440835 A0A1B0GTW7 788 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRR-204ENST00000440835 AP1G2O75843 785 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 CER1O95813 267 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 SLC6A11P48066 632 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 FNTAP49354 379 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 GNG11P61952 73 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 MYL5Q02045 173 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF33AQ06730 810 aa6.29□□□□□ -1.4
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