RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 UCN2Q96RP3 112 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 USP28Q96RU2 1077 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 KCNK16Q96T55 309 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 MMS19Q96T76 1030 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SDCBP2Q9H190 292 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CD248Q9HCU0 757 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CD93Q9NPY3 652 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 KLK13Q9UKR3 277 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SPEGQ15772 3267 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 IGF2RP11717 2491 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 AKAP13Q12802 2813 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 TAF4O00268 1085 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CLIC2O15247 247 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 GREM1O60565 184 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 TULP3O75386 442 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 APODP05090 189 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 EPB42P16452 691 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CASP1P29466 404 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 GRIA2P42262 883 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 WASP42768 502 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 TNFRSF4P43489 277 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 IDH3AP50213 366 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 PDE6CP51160 858 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CDH8P55286 799 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 MYL6P60660 151 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SEMA3BQ13214 749 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 PSMD6Q15008 389 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM25Q86YD3 366 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SYT12Q8IV01 421 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC26Q8TAB7 109 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 ACOX2Q99424 681 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CGRRF1Q99675 332 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SNX25Q9H3E2 840 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 IL37Q9NZH6 218 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CACNA1GO43497 2377 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PQF6 199 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 E2F8A0AVK6 867 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SASH3O75995 380 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 BEST1O76090 585 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 ALDH1A2O94788 518 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CAPNS1P04632 268 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 GLB1P16278 677 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SYT1P21579 422 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 YWHAQP27348 245 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 PPP3CCP48454 512 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CASP4P49662 377 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CYP2J2P51589 502 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CYP24A1Q07973 514 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SLC39A14Q15043 492 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SURF1Q15526 300 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CACNA1EQ15878 2313 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 EOGTQ5NDL2 527 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 LYSMD4Q5XG99 296 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 NUP93Q8N1F7 819 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 FBXO32Q969P5 355 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 PLD4Q96BZ4 506 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 CAPN10Q9HC96 672 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms