RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427332.6

HDAC7-209, Transcript of histone deacetylase 7, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HDAC7, Length 3,016 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7-209ENST00000427332 MPP6Q9NZW5 540 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 SYN3O14994 580 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 HOXA2O43364 376 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 VNN2O95498 520 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 APRTP07741 180 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 ERCC2P18074 760 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 FGFR3P22607 806 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 TAZQ16635 292 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 BBS9Q3SYG4 887 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 SPRED2Q7Z698 418 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 NT5C3BQ969T7 300 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 ZNF670Q9BS34 389 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 WHRNQ9P202 907 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 PPFIA2O75334 1257 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 LRIG2O94898 1065 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 FAM163BP0C2L3 166 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 LMNB2Q03252 620 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 OLIG2Q13516 323 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 RFX8Q6ZV50 586 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 SLCO2A1Q92959 643 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 TOP1MTQ969P6 601 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 IGSF21Q96ID5 467 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 CWH43Q9H720 699 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 CYP4F11Q9HBI6 524 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 TMEM63AO94886 807 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 PTPN7P35236 360 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 LMAN1P49257 510 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 MSS51Q4VC12 460 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 NPWQ8N729 165 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 FAM71BQ8TC56 605 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 CPT1BQ92523 772 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 FAF2Q96CS3 445 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 USP3Q9Y6I4 520 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC7-209ENST00000427332 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 TIMP1P01033 207 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 MYZAPP0CAP1 466 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 RASIP1Q5U651 963 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 ALS2CLQ60I27 953 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 USP33Q8TEY7 942 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 BADQ92934 168 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 AGAP3Q96P47 875 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 H0YGN5 161 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 RIPK2O43353 540 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 USP41Q3LFD5 358 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 NACA2Q9H009 215 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 USP29Q9HBJ7 922 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 MED4Q9NPJ6 270 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 NDFIP2Q9NV92 336 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 NFS1Q9Y697 457 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 PAGE1O75459 146 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 ATF6P18850 670 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 YWHAQP27348 245 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 SCNN1AP37088 669 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 GRIA1P42261 906 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 ARL13BQ3SXY8 428 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 VPS52Q8N1B4 723 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 ARMC5Q96C12 935 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 H3BRJ5 948 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 DFFAO00273 331 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 OPA1O60313 960 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 VAV1P15498 845 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 GPR17Q13304 367 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 TAF12Q16514 161 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 MREGQ8N565 214 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 BHMTQ93088 406 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC7-209ENST00000427332 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms