RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 MX2P20592 715 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 HOXA9P31269 272 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SERPINB6P35237 376 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TBX4P57082 545 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 CALCOCO2Q13137 446 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SEMA3BQ13214 749 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 PTK6Q13882 451 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 PPP1R7Q15435 360 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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HDLBP-211ENST00000425989 TAC4Q86UU9 113 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 JAMLQ86YT9 394 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 PCDH19Q8TAB3 1148 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 POF1BQ8WVV4 589 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 RSAD2Q8WXG1 361 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 BTN2A3PQ96KV6 586 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 CSPG4P5Q96PW8 444 aa9.95□□□□□ -0.82
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HDLBP-211ENST00000425989 NMUR1Q9HB89 426 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 MARCH2Q9P0N8 246 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 GMIPQ9P107 970 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 WHRNQ9P202 907 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 MSRAQ9UJ68 235 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 INSL5Q9Y5Q6 135 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 MYO16Q9Y6X6 1858 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 C2orf71A6NGG8 1288 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 WASH4PA8MWX3 477 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 H3BNC9 293 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TTI1O43156 1089 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TGM5O43548 720 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TLR5O60602 858 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 LATS1O95835 1130 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 GLUD1P00367 558 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 RBP3P10745 1247 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ATF6P18850 670 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.828e-8■■■□□ 16
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HDLBP-211ENST00000425989 BMP8BP34820 402 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 GPR15P49685 360 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 RABGGTBP53611 331 aa9.94□□□□□ -0.82
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HDLBP-211ENST00000425989 USP46P62068 366 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SLC7A5Q01650 507 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 PDK1Q15118 436 aa9.94□□□□□ -0.82
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HDLBP-211ENST00000425989 C10orf120Q5SQS8 335 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
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HDLBP-211ENST00000425989 HDXQ7Z353 690 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ALLCQ8N6M5 410 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC185Q8N715 623 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 KREMEN2Q8NCW0 462 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ACTL9Q8TC94 416 aa9.94□□□□□ -0.82
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HDLBP-211ENST00000425989 CASP10Q92851 521 aa9.94□□□□□ -0.82
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HDLBP-211ENST00000425989 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
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HDLBP-211ENST00000425989 SLC11A2P49281 568 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 HARS2P49590 506 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TPI1P60174 286 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ERVFC1P60507 584 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 VSNL1P62760 191 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TWF1Q12792 350 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 GPM6BQ13491 265 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SNX1Q13596 522 aa9.93□□□□□ -0.82
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