RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.13■■□□□ 1.45
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CNN3-202ENST00000394202 IGLV3-27P01718 113 aa24.12■■□□□ 1.45
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CNN3-202ENST00000394202 GOT1P17174 413 aa24.12■■□□□ 1.45
CNN3-202ENST00000394202 PTPN7P35236 360 aa24.12■■□□□ 1.45
CNN3-202ENST00000394202 TUBP50607 506 aa24.12■■□□□ 1.45
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CNN3-202ENST00000394202 BRMS1LQ5PSV4 323 aa24.12■■□□□ 1.45
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CNN3-202ENST00000394202 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
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CNN3-202ENST00000394202 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
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CNN3-202ENST00000394202 ARTNQ5T4W7 220 aa24.12■■□□□ 1.45
CNN3-202ENST00000394202 TMC5Q6UXY8 1006 aa24.12■■□□□ 1.45
CNN3-202ENST00000394202 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
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CNN3-202ENST00000394202 PQLC3Q8N755 202 aa24.12■■□□□ 1.45
CNN3-202ENST00000394202 WBP2Q969T9 261 aa24.12■■□□□ 1.45
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CNN3-202ENST00000394202 SIK2Q9H0K1 926 aa24.12■■□□□ 1.45
CNN3-202ENST00000394202 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa24.12■■□□□ 1.45
CNN3-202ENST00000394202 CREB3O43889 395 aa24.11■■□□□ 1.45
CNN3-202ENST00000394202 AIF1P55008 147 aa24.11■■□□□ 1.45
CNN3-202ENST00000394202 NNTQ13423 1086 aa24.11■■□□□ 1.45
CNN3-202ENST00000394202 MAB21L3Q8N8X9 362 aa24.11■■□□□ 1.45
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CNN3-202ENST00000394202 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
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CNN3-202ENST00000394202 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
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CNN3-202ENST00000394202 OSBPL2Q9H1P3 480 aa24.09■■□□□ 1.45
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