RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADHFE1Q8IWW8 467 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR52L2PQ8NGH6 319 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ABHD5Q8WTS1 349 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTLL2Q9BWV7 592 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 OBP2AQ9NY56 170 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 VPS4AQ9UN37 437 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 COG5Q9UP83 839 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 EVPLQ92817 2033 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR2W5A6NFC9 320 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 LACTBL1A8MY62 500 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATG13O75143 517 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 SGPL1O95470 568 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 T-ENOLP0DO92 83 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYL4P12829 197 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PGGT1BP53609 377 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAXCQ5TGI0 409 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 RRAGBQ5VZM2 374 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 TLDC1Q6P9B6 456 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZFPM2Q8WW38 1151 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 GLMPQ8WWB7 406 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ASB12Q8WXK4 309 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 KAT2BQ92831 832 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 CTAGE1Q96RT6 745 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PIMREGQ9BSJ6 248 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ERVK-5Q9HDB9 667 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 THSD1Q9NS62 852 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMOD4Q9NZQ9 345 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 SNX13Q9Y5W8 968 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 EMSYQ7Z589 1322 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 KIR2DS3K7RE56 304 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 COQ9O75208 318 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ENO1P06733 434 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 AKR1A1P14550 325 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 HOXB2P14652 356 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 FGFR2P21802 821 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 POLD2P49005 469 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 BFSP2Q13515 415 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 DLGAP5Q15398 846 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTLL5Q6EMB2 1281 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ACSM6Q6P461 480 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 KIAA0408Q6ZU52 694 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 RHPN2Q8IUC4 686 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 LAS2Q8IYD9 372 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADGRF4Q8IZF3 695 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNF152Q8N8N0 203 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATP11CQ8NB49 1132 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTC8Q8TAM2 541 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 APOL5Q9BWW9 433 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYO1AQ9UBC5 1043 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 CORO2BQ9UQ03 480 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A1W2PPC1 479 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A1W2PPC4 97 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 C4orf47A7E2U8 309 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 UGDHO60701 494 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 TSHRP16473 764 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC8A1P32418 973 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 STAT6P42226 847 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZXDBP98169 803 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PPATQ06203 517 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF543Q08ER8 600 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 SEMA3BQ13214 749 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATP1A4Q13733 1029 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PGM5Q15124 567 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ELF2Q15723 593 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC5A9Q2M3M2 681 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMTNL2Q2TAL5 461 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 DLK2Q6UY11 383 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 BEND5Q7L4P6 421 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM199Q8N511 208 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ASB5Q8WWX0 329 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTC17Q96AE7 1141 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRRC46Q96FV0 321 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms