RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384143.1

RNU6-398P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 398, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-398P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-398P-201ENST00000384143 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 TSPAN18Q96SJ8 248 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 KIF2CQ99661 725 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 GABRG3Q99928 467 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 ACBD6Q9BR61 282 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 MSTO1Q9BUK6 570 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 GPR174Q9BXC1 333 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 MUC3BQ9H195 1237 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 C17orf75Q9HAS0 396 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 PDRG1Q9NUG6 133 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 PCMTD2Q9NV79 361 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 DPP3Q9NY33 737 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 KCNK4Q9NYG8 393 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 DEC1Q9P2X7 70 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRWD1Q9UFC0 647 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 DERAQ9Y315 318 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 C2CD2Q9Y426 696 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 SNX11Q9Y5W9 270 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 AK5Q9Y6K8 562 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 PTPRBP23467 1997 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 TENM4Q6N022 2769 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 MYO18BQ8IUG5 2567 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 E2F8A0AVK6 867 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 CAPN8A6NHC0 703 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 METTL12A8MUP2 240 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 B8ZZF3 427 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 H0Y8X5 98 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC28A2O43868 658 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 BRINP1O60477 761 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 JAK2O60674 1132 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 PRMT3O60678 531 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 PIGRP01833 764 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 JUPP14923 745 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 PFKLP17858 780 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 BDNFP23560 247 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 BRD2P25440 801 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 SSTR4P31391 388 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 GRK6P43250 576 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 MAGEA11P43364 429 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 PDE6CP51160 858 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 ATP11AP98196 1134 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 GUCY1B3Q02153 619 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 GAD2Q05329 585 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 DNAJC3Q13217 504 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 RTP5Q14D33 572 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 KYAT1Q16773 422 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 ANO4Q32M45 955 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 FUT11Q495W5 492 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 SV2CQ496J9 727 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 HES3Q5TGS1 186 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 GRAMD4Q6IC98 578 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 USP49Q70CQ1 688 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 ERICH1Q86X53 443 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 TMEM25Q86YD3 366 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 NECAB1Q8N987 351 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 IGSF22Q8N9C0 903 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 CXorf38Q8TB03 319 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 WASF1Q92558 559 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 KCNN1Q92952 543 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 MYLPFQ96A32 169 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 P2RY11Q96G91 374 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF560Q96MR9 790 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 ARID3AQ99856 593 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 TTLL2Q9BWV7 592 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 TM6SF1Q9BZW5 370 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 TRIM4Q9C037 500 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 RBSNQ9H1K0 784 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 IKZF4Q9H2S9 585 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 CRTAC1Q9NQ79 661 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 SPHK2Q9NRA0 654 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 DNM3Q9UQ16 869 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 PI4KAP42356 2102 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 OBSL1O75147 1896 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 KALRNO60229 2985 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 SPTA1P02549 2419 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 ANKRD63C9JTQ0 380 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 F8VP50 259 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-398P-201ENST00000384143 LINC01387J3KSC0 135 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms