RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384006.1

RNU6-641P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 641, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-641P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-641P-201ENST00000384006 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
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RNU6-641P-201ENST00000384006 PTGFRNQ9P2B2 879 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-641P-201ENST00000384006 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
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RNU6-641P-201ENST00000384006 GAB1Q13480 694 aa3.68□□□□□ -1.82
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