RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316881.8

TRIM25-201, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM25, Length 5,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-201ENST00000316881 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.68□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.68□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 BCL9O00512 1426 aa14.68□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.068e-6■■■■■ 107
TRIM25-201ENST00000316881 TPBGLP0DKB5 382 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 GNRH1P01148 92 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 LONP2Q86WA8 852 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 ERP27Q96DN0 273 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SENP8Q96LD8 212 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 ASAH2Q9NR71 780 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SLITRK3O94933 977 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 MDM1Q8TC05 714 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 OMDQ99983 421 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 WHRNQ9P202 907 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 LOC100653049A0A140TA62 436 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 KRT34O76011 436 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 RECQL4O94761 1208 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 S100A5P33763 92 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 PPM1AP35813 382 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 WLSQ5T9L3 541 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 FAM136AQ96C01 138 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 IRF6O14896 467 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 ADH1AP07327 375 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CCNG1P51959 295 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 PGS1Q32NB8 556 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 TEX9Q8N6V9 391 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 PANX3Q96QZ0 392 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SH3GL1Q99961 368 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14.67□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 MICAL2O94851 1124 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 PPP2R1BP30154 601 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CNDP1Q96KN2 507 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 MAP10Q9P2G4 905 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 BDNFP23560 247 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SERPINA4P29622 427 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 GCNT1Q02742 428 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CCNG2Q16589 344 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 ADCK1Q86TW2 530 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 C11orf74Q86VG3 221 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 SEPT3Q9UH03 358 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 FAM86B1E9PN63 330 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CAPN15O75808 1086 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 MGAT5Q09328 741 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 ZNF544Q6NX49 715 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 A0A088AWK7 358 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 TMEM114B3SHH9 223 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 NEK2P51955 445 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 PSMC6P62333 389 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 TATDN2Q93075 761 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 KRT84Q9NSB2 600 aa14.66□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 RAD51BO15315 384 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 GLRBP48167 497 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 CSHL1Q14406 222 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 C16orf72Q14CZ0 275 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 MED8Q96G25 268 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM25-201ENST00000316881 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms