RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000209256.1

Ptpre-202, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpre, Length 2,593 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Exoc3l4Q6DIA2 721 aa21.42■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Trpv1Q704Y3 839 aa21.42■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa21.42■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Pcdhb10Q91VE5 797 aa21.42■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Basp1Q91XV3 226 aa21.42■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 SerhlQ9EPB5 311 aa21.42■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Caln1Q9JJG7 219 aa21.42■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Kcng2F7A6P6 480 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Pgk1P09411 417 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Tll1Q62381 1013 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Cand1Q6ZQ38 1230 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mul1Q8VCM5 352 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mospd1Q8VEL0 213 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 DaglbQ91WC9 669 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Cul2Q9D4H8 745 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Zfp946F6VWU8 523 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Dpy19l2P0CW70 773 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Lamp2P17047 415 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Gria2P23819 883 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Epb41P48193 858 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Ankrd13bQ5F259 626 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 9930111J21Rik1Q5SVP0 844 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Abhd10Q6PE15 297 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Gpr20Q8BYC4 358 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Pnma1Q8C1C8 353 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Slc5a9Q8VDT1 685 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Rnf31Q924T7 1066 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 AadacQ99PG0 398 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Arpc2Q9CVB6 300 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Kifc5bE9PUA5 672 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Ifi206G3UZV2 921 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 2610028H24RikG5E8K1 270 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Neu1O35657 409 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 BpgmP15327 259 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Cst8P32766 142 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Zscan2Q07230 614 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Ccndbp1Q3TVC7 356 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Lsg1Q3UM18 644 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Bpifa3Q9D9J8 232 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Olig1Q9JKN5 260 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Gyg1Q9R062 333 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Dicer1Q8R418 1916 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mup10A2BIN1 180 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mup14A2CEK7 180 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mup19A9C497 187 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mup15A9R9W0 180 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mup17B5X0G2 180 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Osbpl8B9EJ86 889 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mup8E9PVW0 235 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mup7E9QA79 235 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Dpysl4O35098 572 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mup6P02762 180 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Pgk2P09041 417 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mup1P11588 180 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mup2P11589 180 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 HmgcrQ01237 887 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Col9a2Q07643 688 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 E330034G19RikQ3UWX6 351 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Zfp956Q3UZY6 572 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Gpatch2lQ6PE65 482 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Olfr1037Q7TR84 321 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Ip6k2Q80V72 448 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Qsox1Q8BND5 748 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Trim32Q8CH72 655 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Rhobtb2Q91V93 728 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Mtfr1Q99MB2 328 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Actrt2Q9D9L5 377 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Spag4Q9JJF2 443 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Plagl1Q9JLQ4 704 aa21.4■■□□□ 1.02
Ptpre-202ENSMUST00000209256 PiggD3Z3Y1 983 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Zscan4bE9Q3G0 505 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Slc1a6O35544 561 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Aqp4P55088 323 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Sox10Q04888 466 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Cd300lgQ1ERP8 331 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Zbtb48Q1H9T6 681 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Pitpnm3Q3UHE1 974 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Abi3bpQ59IW6 1179 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Rab34Q64008 259 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Tmem130Q6NXM3 419 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Tdrd7Q8K1H1 1086 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Creb5Q8K1L0 357 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Noxred1Q9D3S5 366 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 CtsjQ9R014 334 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Bscl2Q9Z2E9 383 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Naa20P61600 178 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Tcf12Q61286 706 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Nkiras1Q8CEC5 192 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Homer3Q99JP6 356 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Commd8Q9CZG3 183 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Serpinb3bQ9D1Q5 387 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Vwa7Q9JHA8 891 aa21.39■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Cntnap5cQ0V8T7 1305 aa21.38■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Plcg1Q62077 1302 aa21.38■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Cyp2j6O54750 501 aa21.38■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Hcn2O88703 863 aa21.38■■□□□ 1.01
Ptpre-202ENSMUST00000209256 Sipa1P46062 1037 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.5 ms