RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AxlQ00993 888 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 VcpQ01853 806 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Krt80Q0VBK2 452 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nr2c1Q505F1 590 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cd6Q61003 665 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zdhhc24Q6IR37 284 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc38a9Q8BGD6 560 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 FsbpQ8BKE5 299 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Shc2Q8BMC3 573 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dus1lQ8C2P3 475 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Uba6Q8C7R4 1053 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ddx1Q91VR5 740 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pex6Q99LC9 981 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rmdn1Q9DCV4 305 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nmnat1Q9EPA7 285 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cul1Q9WTX6 776 aa29.81■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Apol7bB1AQP7 369 aa29.8■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 4930444G20RikD3Z741 495 aa29.8■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Marcksl1P28667 200 aa29.8■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AdprhP54923 362 aa29.8■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Csf2raQ00941 388 aa29.8■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pld5Q3UNN8 536 aa29.8■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Apol7eQ3UZ24 369 aa29.8■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfml2bQ3V1G4 746 aa29.8■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Znf532Q6NXK2 1036 aa29.8■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam185aQ7TPD2 378 aa29.8■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc51bQ80WK2 128 aa29.8■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fundc1Q9DB70 155 aa29.8■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ParvbQ9ES46 365 aa29.8■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ecel1Q9JMI0 775 aa29.8■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm12695A2AGB2 545 aa29.79■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 LdhcP00342 332 aa29.79■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gas2P11862 314 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hsd17b1P51656 344 aa29.79■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CidecP56198 239 aa29.79■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lipo3Q3UT41 399 aa29.79■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vtcn1Q7TSP5 283 aa29.79■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr1353Q8VGU8 309 aa29.79■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rnf135Q9CWS1 417 aa29.79■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rpl34Q9D1R9 117 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Oser1Q9D722 291 aa29.79■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc2a5Q9WV38 501 aa29.79■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rad9aQ9Z0F6 389 aa29.79■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plxna4Q80UG2 1893 aa29.79■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ces1bD3Z5G7 567 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zc3h12bG3X9I7 835 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Psmc3O88685 442 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp42P22227 288 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wbp2P97765 261 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rassf4Q8CB96 322 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Acad9Q8JZN5 625 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Znrf4Q9DAH2 327 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyp4v2Q9DBW0 525 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rp1P56716 2095 aa29.78■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AspgA0JNU3 564 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zscan5bB2RTN3 468 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lonrf1D3YY23 762 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Man2b1O09159 1013 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ring1O35730 406 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Il2P04351 169 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Emilin3P59900 758 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plpp4Q0VBU9 271 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pknox2Q8BG99 474 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc7a4Q8BLQ7 635 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wdr59Q8C0M0 992 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q8CDN1 933 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn1r213Q8R278 384 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Uhrf1Q8VDF2 782 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc25a3Q8VEM8 357 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc12a6Q924N4 1150 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sytl2Q99N50 950 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bzw1Q9CQC6 419 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GsapQ3TCV3 858 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pid1Q3UBG2 217 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AcrbpQ3V140 540 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Msi1Q61474 362 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arhgap30Q640N3 1101 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kif11Q6P9P6 1052 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp512bQ6PHP4 879 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rnf187Q8BFX1 236 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Chmp2aQ9DB34 222 aa29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccnyl1D3YUJ3 367 aa29.76■■■□□ 2.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn2r67K7N6T2 851 aa29.76■■■□□ 2.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfy1P10925 782 aa29.76■■■□□ 2.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sdr16c6Q05A13 316 aa29.76■■■□□ 2.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arnt2Q61324 712 aa29.76■■■□□ 2.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam118bQ8C569 351 aa29.76■■■□□ 2.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cox18Q8VC74 331 aa29.76■■■□□ 2.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cd300ldQ8VCH2 221 aa29.76■■■□□ 2.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rnf112Q96DY5 654 aa29.76■■■□□ 2.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tspan17Q9D7W4 270 aa29.76■■■□□ 2.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc39a5Q9D856 535 aa29.76■■■□□ 2.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nup210Q9QY81 1886 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tubb1A2AQ07 451 aa29.75■■■□□ 2.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pold2O35654 469 aa29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.4 ms