RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088716.11

Smarcc1-201, Transcript of SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smarcc1, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Smyd2Q8R5A0 433 aa22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Il13ra2O88786 383 aa22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Prl2c2P04095 224 aa22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Elk3P41971 409 aa22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Itga7Q61738 1179 aa22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Dsg1bQ7TSF1 1060 aa22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa22.15■■□□□ 1.14
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ptpn5P54830 541 aa22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Calb2Q08331 271 aa22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Zfp607aQ3TQG9 686 aa22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Rmdn3Q3UJU9 470 aa22.15■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 HltfQ6PCN7 1003 aa22.15■■□□□ 1.14
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Gm8237E9Q257 205 aa22.14■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Tsc22d2E9Q7M2 769 aa22.14■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Plk4Q64702 925 aa22.14■■□□□ 1.14
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Nckap1lQ8K1X4 1134 aa22.14■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Eva1bQ8K2Y3 164 aa22.14■■□□□ 1.14
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 A930018M24RikB7ZMY3 218 aa22.14■■□□□ 1.14
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Cyp2c65Q148B1 490 aa22.14■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Gsdmc2Q2KHK6 480 aa22.14■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Plekhf1Q3TB82 279 aa22.14■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Zdhhc3Q8R173 299 aa22.14■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Dqx1Q924H9 718 aa22.14■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Bbs2Q9CWF6 721 aa22.14■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Cul2Q9D4H8 745 aa22.14■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ift46Q9DB07 301 aa22.14■■□□□ 1.14
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 RereQ80TZ9 1558 aa22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 CenpaO35216 134 aa22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Akr1b7P21300 316 aa22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 N4bp2l2Q8JZS6 575 aa22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ccdc59Q8R2N0 240 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Duoxa2Q9D311 320 aa22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Gm8011K7N6Y5 207 aa22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Mrgprx2Q3UG50 352 aa22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Zbtb12Q9Z150 459 aa22.14■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 EpoP07321 192 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Il1rapl1P59823 695 aa22.13■■□□□ 1.13
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ifi44Q8BV66 422 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Plod3Q9R0E1 741 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Nipsnap3aB1AWZ3 247 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Gm3526E9PZM0 191 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Gabpb1Q00420 383 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Zswim9Q6DI92 447 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Btnl9Q8BJE2 536 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Olfr532Q8VGT4 309 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Akr1c21Q91WR5 323 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Rsrc2A2RTL5 376 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Pon1P52430 355 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Pla2g6P97819 807 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Cep295nlQ497N6 533 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Zfp263Q8CF60 680 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Slc39a3Q99K24 317 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 AfpP02772 605 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 NcstnP57716 708 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Txndc8Q69AB2 127 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Gpr141Q7TQP0 305 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 PpatQ8CIH9 517 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Cib4Q9D9N5 185 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Magea4F2Z493 315 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Dcpp3L7N259 170 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Srpk1O70551 648 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 AvilO88398 819 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Nr6a1Q64249 495 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Zfp943Q6NZP4 507 aa22.13■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Slc1a2P43006 572 aa22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Rps7P62082 194 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Etv6P97360 485 aa22.12■■□□□ 1.13
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Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Usp1Q8BJQ2 784 aa22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 UstQ8BUB6 407 aa22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ndufs1Q91VD9 727 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Tfap2dQ91ZK0 452 aa22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 MutyhQ99P21 515 aa22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Pbld2Q9CXN7 288 aa22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Wee1P47810 646 aa22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 IdsQ08890 552 aa22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Dph1Q5NCQ5 438 aa22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Q8VDP2 222 aa22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Txndc12Q9CQU0 170 aa22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ap4s1Q9WVL1 144 aa22.12■■□□□ 1.13
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Gm21149A0A0G2JFY7 255 aa22.12■■□□□ 1.13
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