RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam192aQ91WE2 254 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Txndc9Q9CQ79 226 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hcn4O70507 1186 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp46P62069 366 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fmo3P97501 534 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adcy6Q01341 1165 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrgprx2Q3UG50 352 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pitpnm3Q3UHE1 974 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ADGRF3Q58Y75 991 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kct2Q8K201 259 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Upb1Q8VC97 393 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BsndQ8VIM4 307 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psip1Q99JF8 528 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem59Q9QY73 323 aa16.52■□□□□ 0.24
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa16.52■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r87E9PZX4 848 aa16.52■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chrna1P04756 457 aa16.52■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PcnaP17918 261 aa16.52■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Polr1bP70700 1135 aa16.52■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Marveld2Q3UZP0 555 aa16.52■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ssh3Q8K330 649 aa16.52■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam212aQ9CX62 282 aa16.52■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Drc3Q9D5E4 523 aa16.52■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C1qtnf1Q9QXP7 281 aa16.52■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sept6Q9R1T4 434 aa16.52■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lamb2Q61292 1799 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttc30a2A2AKQ8 664 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2c69E9PXC3 491 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnmt3aO88508 908 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Magea6O89010 325 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CblP22682 913 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2c40P56657 491 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arf4P61750 180 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psg28Q4KL66 472 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim24Q64127 1051 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Syn2Q64332 586 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kctd12Q6WVG3 327 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stk40Q7TNL3 435 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arhgap15Q811M1 481 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dars2Q8BIP0 653 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cops7bQ8BV13 264 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Osbpl6Q8BXR9 959 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ItchQ8C863 864 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Panx3Q8CEG0 392 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ap3m2Q8R2R9 418 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tas1r2Q925I4 843 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Borcs5Q9D920 195 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rmdn1Q9DCV4 305 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc86Q9JJ89 426 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Iigp1Q9QZ85 413 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arhgef10Q8C033 1345 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Casp2P29594 452 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NcstnP57716 708 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dlg3P70175 849 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 B3gntl1Q3U129 357 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam198aQ3UY90 562 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atg9bQ6EBV9 922 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam181bQ80VF6 417 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BoraQ8BS90 525 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc38a7Q8BWH0 463 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gtpbp10Q8K013 366 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igdcc4Q9EQS9 1252 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbck1Q9WUB0 508 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Col4a3Q9QZS0 1669 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhl33G3UW92 533 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AmacrO09174 381 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HmgcrQ01237 887 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cand1Q6ZQ38 1230 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp759Q7M6X3 721 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kctd12bQ8C7J6 292 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prpsap2Q8R574 369 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr393Q8VGR6 312 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cacng4Q9JJV4 327 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RecqlQ9Z129 648 aa16.51■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp34Q6ZQ93 3582 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 OmdO35103 423 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IkbkgO88522 412 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfm1O88998 485 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Msr1P30204 458 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mxd1P50538 227 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HdxQ14B70 692 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MyrfQ3UR85 1138 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Brsk2Q69Z98 735 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf512Q69Z99 562 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prl3a1Q78Y73 227 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q810S2 196 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhl38Q8BSF5 581 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc29a1Q9JIM1 460 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PigqQ9QYT7 581 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Magel2Q9QZ04 1284 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxl18E9PYR1 771 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr67F8VPJ8 320 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm43302L7N1X8 611 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccnd3P30282 292 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gbp10Q000W5 611 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxo39Q5NBU5 443 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fastkd1Q6DI86 829 aa16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43 ms