RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	PSMC3	P17980	439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	GJA9	P57773	515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	STK4	Q13043	487 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	OXR1	Q8N573	874 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	FGB	P02675	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF132	P52740	706 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	TMED2	Q15363	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MTMR9	Q96QG7	549 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	TBCB	Q99426	244 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	AHCYL1	O43865	530 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	IGFBP4	P22692	258 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	GMFB	P60983	142 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ART5	Q96L15	291 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ARVCF	O00192	962 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	VILL	O15195	856 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	TTI1	O43156	1089 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	NR2C2	P49116	596 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SCNN1G	P51170	649 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CDC16	Q13042	620 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CACNA1H	O95180	2353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DFFA	O00273	331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	IRAK2	O43187	625 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	LGR5	O75473	907 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SERPING1	P05155	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PRKACA	P17612	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PLCG1	P19174	1290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ARL3	P36405	182 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MORC3	Q14149	939 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ABCG8	Q9H221	673 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CEP72	Q9P209	647 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	KRT1	P04264	644 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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