RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	AP1B1	Q10567	949 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	NME3	Q13232	169 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	STK32A	Q8WU08	396 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	MCM8	Q9UJA3	840 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PIR	O00625	290 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TREH	O43280	583 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	MYL2	P10916	166 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	VAV1	P15498	845 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CCND1	P24385	295 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ARL4A	P40617	200 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TTC7B	Q86TV6	843 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CCNY	Q8ND76	341 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	USP6NL	Q92738	828 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	KCNK13	Q9HB14	408 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SUFU	Q9UMX1	484 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	WDR27	A2RRH5	827 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	HUS1	O60921	280 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	GCAT	O75600	419 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	RFPL1	O75677	317 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PRKCH	P24723	683 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TMPRSS15	P98073	1019 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	LGSN	Q5TDP6	509 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	NME8	Q8N427	588 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	FAM13C	Q8NE31	585 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ADAM32	Q8TC27	787 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152		H0Y3Z8	333 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	MFSD11	O43934	449 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	TAF6	P49848	677 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	GRB14	Q14449	540 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	SNX17	Q15036	470 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	EBF2	Q9HAK2	575 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	DONSON	Q9NYP3	566 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	ARMCX1	Q9P291	453 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	PLLP	Q9Y342	182 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-222	ENST00000635152	HMX2	A2RU54	273 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	KRT38	O76015	456 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	HAUS5	O94927	633 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CD4	P01730	458 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	GM2A	P17900	193 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	RASSF2	P50749	326 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	BEX3	Q00994	111 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CHI3L2	Q15782	390 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	OSTM1	Q86WC4	334 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CHSY1	Q86X52	802 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MCU	Q8NE86	351 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SPON1	Q9HCB6	807 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MATK	P42679	507 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	NR2C2	P49116	596 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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