RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591600.1

APOC4-201, Transcript of apolipoprotein C4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene APOC4, Length 348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-201ENST00000591600 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 STARD3Q14849 445 aa16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 GEN1Q17RS7 908 aa16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 FUT11Q495W5 492 aa16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 COBLL1Q53SF7 1204 aa16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 SYCP2LQ5T4T6 812 aa16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 UCMAQ8WVF2 138 aa16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 BHMTQ93088 406 aa16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 CCDC34Q96HJ3 373 aa16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 MARCH2Q9P0N8 246 aa16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 RASAL2Q9UJF2 1139 aa16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 STRIP2Q9ULQ0 834 aa16.09■□□□□ 0.17
APOC4-201ENST00000591600 TIMM44O43615 452 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 ZBED1O96006 694 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 IGLV3-19P01714 112 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 CYBBP04839 570 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 C7P10643 843 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 GNSP15586 552 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 CD6P30203 668 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 TKTL1P51854 596 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 WDR45BQ5MNZ6 344 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 DENND1CQ8IV53 801 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 MINDY1Q8N5J2 469 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 CADM4Q8NFZ8 388 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 DNASE2BQ8WZ79 361 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 GATA6Q92908 595 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 TATDN2Q93075 761 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 PLD4Q96BZ4 506 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 ARID3AQ99856 593 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 SLC6A17Q9H1V8 727 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 ELOVL2Q9NXB9 296 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa16.08■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 FAM221BA6H8Z2 402 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 H0Y626 953 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 GJB3O75712 270 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 TRIM16O95361 564 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 CD59P13987 128 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 IL12RB1P42701 662 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 BHLHA9Q7RTU4 235 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 RGL4Q8IZJ4 473 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 SCML4Q8N228 414 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 EEF2KMTQ96G04 330 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 CD93Q9NPY3 652 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 FSCN3Q9NQT6 498 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 RMND1Q9NWS8 449 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 STOML2Q9UJZ1 356 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 AKAP13Q12802 2813 aa16.07■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 SLC12A8A0AV02 714 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 HMBSP08397 361 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 SPINK2P20155 84 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 OXTRP30559 389 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 RDXP35241 583 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 PRCPP42785 496 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 TPMTP51580 245 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 BCAT1P54687 386 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 ZNF445P59923 1031 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 PDE4CQ08493 712 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 PLEKHG6Q3KR16 790 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 CBWD6Q4V339 395 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 CBWD3Q5JTY5 395 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 CBWD5Q5RIA9 395 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 TMPRSS6Q8IU80 811 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 DDI1Q8WTU0 396 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 KCTD13Q8WZ19 329 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 GSDMAQ96QA5 445 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 TSPAN16Q9UKR8 245 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 MSRB2Q9Y3D2 182 aa16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa16.05■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 LATS1O95835 1130 aa16.05■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 HARS2P49590 506 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
APOC4-201ENST00000591600 COPAP53621 1224 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms