RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 LRP3O75074 770 aa16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 RHOBTB1O94844 696 aa16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 LATS1O95835 1130 aa16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 PENKP01210 267 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 NTSR1P30989 418 aa16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 ID4P47928 161 aa16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC11A2P49281 568 aa16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 TBX4P57082 545 aa16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 SPEM2Q0P670 501 aa16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 MIIPQ5JXC2 388 aa16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 FYB2Q5VWT5 728 aa16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 MSANTD2Q6P1R3 559 aa16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 LOXL4Q96JB6 756 aa16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 SERPINB11Q96P15 392 aa16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 ACP6Q9NPH0 428 aa16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 SPAG17Q6Q759 2223 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 ANTXRLA6NF34 631 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 E5RJQ4 531 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 TSPAN3O60637 253 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 GABBR2O75899 941 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 HOXB2P14652 356 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 SDHBP21912 280 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 WASP42768 502 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 RPL34P49207 117 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 LMNB2Q03252 620 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 ARID5AQ03989 594 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 STX1AQ16623 288 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 FKBP15Q5T1M5 1219 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 ADGRF1Q5T601 910 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM92Q6UXU6 159 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 KBTBD6Q86V97 674 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 RASSF3Q86WH2 238 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 HMGB4Q8WW32 186 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 SPACA7Q96KW9 195 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC4A5Q9BY07 1137 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC2A11Q9BYW1 496 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 SYNCQ9H7C4 482 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 SIX2Q9NPC8 291 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 TAB2Q9NYJ8 693 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-215ENST00000589825 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa16.77■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 PRRT4C9JH25 899 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 MAP3K13O43283 966 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 CISD3P0C7P0 127 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGAP8P85298 464 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 RING1Q06587 406 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 PDCLQ13371 301 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM110Q86TL2 294 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 PASD1Q8IV76 773 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 MDGA1Q8NFP4 955 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 VPS16Q9H269 839 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 POPDC2Q9HBU9 364 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 FBXO10Q9UK96 956 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 PCDHGC3Q9UN70 934 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 INVSQ9Y283 1065 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 EML5Q05BV3 1969 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 ADAM23O75077 832 aa16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 PLK5Q496M5 336 aa16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM217AQ8IXS0 508 aa16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 LHX5Q9H2C1 402 aa16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 SEMA4GQ9NTN9 838 aa16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 STOML2Q9UJZ1 356 aa16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 TLR6Q9Y2C9 796 aa16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 GPR179Q6PRD1 2367 aa16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 CFAP54Q96N23 3096 aa16.74■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 GFRA2O00451 464 aa16.74■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 DCLK1O15075 740 aa16.74■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 NPC1O15118 1278 aa16.74■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 IRAK2O43187 625 aa16.74■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 ACSL4O60488 711 aa16.74■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 APOEP02649 317 aa16.74■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 MYL5Q02045 173 aa16.74■□□□□ 0.27
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNMA1Q12791 1236 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms