RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589528.1

ACTN4-211, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-211ENST00000589528 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF234Q14588 700 aa16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 TEAD4Q15561 434 aa16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 CCDC157Q569K6 752 aa16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 LINC00301Q8NCQ3 95 aa16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 TAF4BQ92750 862 aa16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 CYFIP2Q96F07 1278 aa16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 NMUR1Q9HB89 426 aa16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 PNPLA8Q9NP80 782 aa16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 SCUBE2Q9NQ36 999 aa16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa16■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
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ACTN4-211ENST00000589528 KNTC1P50748 2209 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTN4-211ENST00000589528 PPP6R2O75170 966 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTN4-211ENST00000589528 CYP4F3Q08477 520 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTN4-211ENST00000589528 FYB2Q5VWT5 728 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTN4-211ENST00000589528 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 DDI1Q8WTU0 396 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 NT5C1AQ9BXI3 368 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTN4-211ENST00000589528 ELOVL2Q9NXB9 296 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 STRIP2Q9ULQ0 834 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.158e-6■■■□□ 15.8
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ACTN4-211ENST00000589528 CUTAO60888 179 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 AFMP43652 599 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 ASPAP45381 313 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 KIF11P52732 1056 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 COPAP53621 1224 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 CLDN10P78369 228 aa15.98■□□□□ 0.15
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ACTN4-211ENST00000589528 ENPP2Q13822 863 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 ZACNQ401N2 412 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 DENND1CQ8IV53 801 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 DKK4Q9UBT3 224 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 MTMR6Q9Y217 621 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 IGSF10Q6WRI0 2623 aa15.98■□□□□ 0.15
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ACTN4-211ENST00000589528 TNFSF14O43557 240 aa15.97■□□□□ 0.15
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ACTN4-211ENST00000589528 DLG4P78352 724 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 BNC1Q01954 994 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 INAVAQ3KP66 663 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 CEP135Q66GS9 1140 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 SORCS1Q8WY21 1168 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 LHX5Q9H2C1 402 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 EXOC1Q9NV70 894 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 CLIC5Q9NZA1 410 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 BTBD3Q9Y2F9 522 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 BPTFQ12830 3046 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 TIMM44O43615 452 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 HLA-DRAP01903 254 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 CD58P19256 250 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 CCT8P50990 548 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 KIF19Q2TAC6 998 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 SHC4Q6S5L8 630 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 DBX2Q6ZNG2 339 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 SV2AQ7L0J3 742 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 SCD5Q86SK9 330 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 MARCH9Q86YJ5 346 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 CEP57L1Q8IYX8 460 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 CCDC150Q8NCX0 1101 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 OR2T3Q8NH03 318 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 TMC2Q8TDI7 906 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 TWNKQ96RR1 684 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 SLC2A11Q9BYW1 496 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 MARCH2Q9P0N8 246 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 PLA2G4CQ9UP65 541 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa15.96■□□□□ 0.15
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