RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF510Q9Y2H8 683 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1W2PQH9 124 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 ENC1O14682 589 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 STC2O76061 302 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 SEMA4FO95754 770 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM200BP0CF97 657 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CFHR1Q03591 330 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 ENPP2Q13822 863 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 Q6ZNB5 142 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 GATAD2AQ86YP4 633 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 OR2T3Q8NH03 318 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 BTBD1Q9H0C5 482 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 SCML2Q9UQR0 700 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CLIC4Q9Y696 253 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM131Q92545 1883 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 KALRNO60229 2985 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 BCAT1P54687 386 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 FYB2Q5VWT5 728 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 DDI1Q8WTU0 396 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF516Q92618 1163 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 BIRC7Q96CA5 298 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 ARID3AQ99856 593 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 NMUR1Q9HB89 426 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 NUMA1Q14980 2115 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 DFNA5O60443 496 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 RFPL3O75679 317 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 RALAP11233 206 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 ABCB4P21439 1286 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CD27P26842 260 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 P2RY11Q96G91 374 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 TMX3Q96JJ7 454 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 OSGEPQ9NPF4 335 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CAPN8A6NHC0 703 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CBX4O00257 560 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 KIF20AO95235 890 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 DNTTP04053 509 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 ITGAVP06756 1048 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CDK4P11802 303 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 P4HA1P13674 534 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CTSKP43235 329 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CXADRP78310 365 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 DNAJC3Q13217 504 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 HES3Q5TGS1 186 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 PDILTQ8N807 584 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 GANCQ8TET4 914 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 DCLK3Q9C098 648 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 SDCBP2Q9H190 292 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 PLA2G4CQ9UP65 541 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 TIMM44O43615 452 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 KLKB1P03952 638 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 HOXD13P35453 343 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 NDST1P52848 882 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 COG7P83436 770 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 EFEMP1Q12805 493 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 NCOA4Q13772 614 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 DENND1CQ8IV53 801 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF366Q8N895 744 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 C12orf29Q8N999 325 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 SKA1Q96BD8 255 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CASP4P49662 377 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 FGF11Q92914 225 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 NRSN2Q9GZP1 204 aa22.84■■□□□ 1.25
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