RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588278.1

TPGS1-202, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Gene TPGS1, Length 2,873 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-202ENST00000588278 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 DTNAQ9Y4J8 743 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 ATP9BO43861 1147 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 DUOXA2Q1HG44 320 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 PDIK1LQ8N165 341 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 TMEM35BQ8NCS4 154 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 ERLEC1Q96DZ1 483 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 OTUD5Q96G74 571 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 CALN1Q9BXU9 219 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 CDH22Q9UJ99 828 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 GINS2Q9Y248 185 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 C19orf81C9J6K1 198 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 CST8O60676 142 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 GRAP2O75791 330 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 FDFT1P37268 417 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 RPL5P46777 297 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 STT3AP46977 705 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 CCR3P51677 355 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 PTP4A2Q12974 167 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 SH2D4BQ5SQS7 431 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 MROH9Q5TGP6 573 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 DENND1BQ6P3S1 775 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 KLC3Q6P597 504 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 CRLF3Q8IUI8 442 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 JOSD2Q8TAC2 188 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 RSAD2Q8WXG1 361 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 TMIGD2Q96BF3 282 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 DCUN1D1Q96GG9 259 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 CATSPER2Q96P56 530 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 RNF19AQ9NV58 838 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa16.09■□□□□ 0.17
TPGS1-202ENST00000588278 TMEM191CA6NGB0 347 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 ARIH2O95376 493 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 CCDC166P0CW27 439 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 CXCL8P10145 99 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 CYTH1Q15438 398 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 CDO1Q16878 200 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 TRIM72Q6ZMU5 477 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 MOB2Q70IA6 237 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 AGR3Q8TD06 166 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 ZNF778Q96MU6 729 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 SIKE1Q9BRV8 207 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 CCDC28BQ9BUN5 200 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 STAM2O75886 525 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 ASS1P00966 412 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 RPS12P25398 132 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 MYBPC1Q00872 1141 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 VGLL4Q14135 290 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 TAF5Q15542 800 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 KCTD21Q4G0X4 260 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 EEF1DP3Q658K8 133 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 ATG14Q6ZNE5 492 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 RCOR2Q8IZ40 523 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 MAN1C1Q9NR34 630 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 SLC17A6Q9P2U8 582 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 DOLKQ9UPQ8 538 aa16.08■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 H3BNX3 289 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 DNAJA2O60884 412 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 ALDH1A3P47895 512 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 PSMD7P51665 324 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 CLDN10P78369 228 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 CNGA3Q16281 694 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 TMEM259Q4ZIN3 620 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 ZBTB46Q86UZ6 589 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 PHTF2Q8N3S3 785 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 SLC44A1Q8WWI5 657 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 SEPT1Q8WYJ6 367 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 PPP1R36Q96LQ0 422 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 NIF3L1Q9GZT8 377 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 SRGAP2BP0DMP2 458 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 KRT3P12035 628 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 KCNA4P22459 653 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 ABCD1P33897 745 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 CDKN2BP42772 138 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 OAZ1P54368 228 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 SNAPC2Q13487 334 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 TEX44Q53QW1 395 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 TFDP3Q5H9I0 405 aa16.07■□□□□ 0.16
TPGS1-202ENST00000588278 FAM160B1Q5W0V3 765 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms