RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 DENND1CQ8IV53 801 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 OR2I1PQ8NGU4 316 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 GATA6Q92908 595 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 ZZEF1O43149 2961 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 STX10O60499 249 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF202O95125 648 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 SYPP08247 313 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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TRAF4-216ENST00000586813 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
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TRAF4-216ENST00000586813 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.28■□□□□ 0.84
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TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD52Q8NB46 1076 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 FOXJ1Q92949 421 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.28■□□□□ 0.84
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TRAF4-216ENST00000586813 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 SPEGQ15772 3267 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 SLC12A8A0AV02 714 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM8BA6NDV4 472 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 CETN3O15182 167 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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TRAF4-216ENST00000586813 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAF4-216ENST00000586813 FAM217AQ8IXS0 508 aa20.27■□□□□ 0.84
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TRAF4-216ENST00000586813 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa20.27■□□□□ 0.84
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TRAF4-216ENST00000586813 GNSP15586 552 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 CBWD6Q4V339 395 aa20.26■□□□□ 0.83
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TRAF4-216ENST00000586813 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.26■□□□□ 0.83
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TRAF4-216ENST00000586813 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 MAOBP27338 520 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 BCAT1P54687 386 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 FAM193AP78312 1265 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 PDE4CQ08493 712 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 CUL2Q13617 745 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF234Q14588 700 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 E2F5Q15329 346 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 DDI1Q8WTU0 396 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 CIPCQ9C0C6 399 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 KLK13Q9UKR3 277 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 MEI4A8MW99 385 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 KCNJ18B7U540 433 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 GJB3O75712 270 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 NCAM1P13591 858 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 PRKCHP24723 683 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 GRIK2Q13002 908 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 SLC14A1Q13336 389 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 PNOCQ13519 176 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM215Q68D42 235 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 SORCS1Q8WY21 1168 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 GPR174Q9BXC1 333 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF4-216ENST00000586813 LRRC4Q9HBW1 653 aa20.24■□□□□ 0.83
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