RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	ASNS	P08243	561 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	FER	P16591	822 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC9A1	P19634	815 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	NR2F2	P24468	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP2C19	P33261	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	HSPA1L	P34931	641 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC16A2	P36021	539 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PRKCI	P41743	596 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ENPEP	Q07075	957 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SPIDR	Q14159	915 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GIT2	Q14161	759 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	NAB2	Q15742	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ASIC2	Q16515	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PRR16	Q569H4	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	LPAR1	Q92633	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PBK	Q96KB5	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289		E9PMD0	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289		H0YCG3	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC188	H7C350	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	NRP1	O14786	923 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PMM2	O15305	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	EDIL3	O43854	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GAS7	O60861	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RAMP2	O60895	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	APOL3	O95236	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GH2	P01242	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	NR3C1	P04150	777 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT13	P13646	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CD40	P25942	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	STAT1	P42224	750 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PRELP	P51888	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RABGGTB	P53611	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TNNC1	P63316	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TCP10	Q12799	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TNFAIP1	Q13829	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CASP8	Q14790	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	UBE2S	Q16763	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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