RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-216ENST00000583282 CYP1A2P05177 515 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 TMEM253P0C7T8 217 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 TCF3P15923 654 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 GGCXP38435 758 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 GPC5P78333 572 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 SLC25A52Q3SY17 297 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 CCDC14Q49A88 953 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 RAB6CQ53S08 254 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 FAM172AQ8WUF8 416 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 NXPE3Q969Y0 559 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 NPY6RQ99463 290 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 EBF3Q9H4W6 596 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 PIGVQ9NUD9 493 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 ANAPC7Q9UJX3 599 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.58□□□□□ -0.07
GGA3-216ENST00000583282 E2F8A0AVK6 867 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 IGLV3-27P01718 113 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 KLKB1P03952 638 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 GBP1P32455 592 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 MAGEA1P43355 309 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 CCZ1BP86790 482 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 NNTQ13423 1086 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 KIAA1328Q86T90 577 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 FAM131BQ86XD5 332 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 BHMTQ93088 406 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 HPS4Q9NQG7 708 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 RRN3Q9NYV6 651 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 CHADO15335 359 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 NRDCO43847 1150 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 GREM1O60565 184 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 SRFP11831 508 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 DESP17661 470 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 PTPN9P43378 593 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 SOX9P48436 509 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 EML3Q32P44 896 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 Q6ZNB5 142 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 ARCQ7LC44 396 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 CHSY1Q86X52 802 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 RFFLQ8WZ73 363 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 SLC39A13Q96H72 371 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 DCLK3Q9C098 648 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 GTSE1Q9NYZ3 720 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 CA14Q9ULX7 337 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.57□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 TMEM191CA6NGB0 347 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 LCA5LO95447 670 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 CYP17A1P05093 508 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 CCR1P32246 355 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 HDAC4P56524 1084 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 RING1Q06587 406 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 PDGFRLQ15198 375 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 HTR3DQ70Z44 454 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 CPA6Q8N4T0 437 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 IRF7Q92985 503 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 ATP2A3Q93084 1043 aa14.56□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 CNPY3Q9BT09 278 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms