RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 AAASQ9NRG9 546 aa30.18■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 IGLV3-25P01717 112 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUDT17P0C025 328 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 AMPD1P23109 780 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 LBX1P52954 281 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 DDR2Q16832 855 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 DENND2CQ68D51 928 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa30.17■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ATAD1Q8NBU5 361 aa30.17■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 IGSF21Q96ID5 467 aa30.17■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SHOC2Q9UQ13 582 aa30.17■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SMAPO00193 183 aa30.16■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HCAR3P49019 387 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEP85LQ5SZL2 805 aa30.16■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM199Q8N511 208 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 RTP4Q96DX8 246 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 SEMA4AQ9H3S1 761 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 COMMD8Q9NX08 183 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL37Q9NZH6 218 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 VPS18Q9P253 973 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 COL4A6Q14031 1691 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM43BA6NCK2 446 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACTN2P35609 894 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 MFSD5Q6N075 450 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCD5Q86SK9 330 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 RELL1Q8IUW5 271 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 EPB41L4BQ9H329 900 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 SMOC2Q9H3U7 446 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 CREB3O43889 395 aa30.15■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SEMA3BQ13214 749 aa30.15■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 RFX8Q6ZV50 586 aa30.15■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPATA17Q96L03 361 aa30.15■■■□□ 2.42
CTDNEP1-208ENST00000573600 USP29Q9HBJ7 922 aa30.15■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF34Q969K3 372 aa30.14■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C4orf22Q6V702 233 aa30.13■■■□□ 2.41
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC8B1Q6J4K2 584 aa30.13■■■□□ 2.41
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
CTDNEP1-208ENST00000573600 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANLNQ9NQW6 1124 aa30.13■■■□□ 2.41
CTDNEP1-208ENST00000573600 ETNK2Q9NVF9 386 aa30.13■■■□□ 2.41
CTDNEP1-208ENST00000573600 DTLQ9NZJ0 730 aa30.13■■■□□ 2.41
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