RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.09■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DSEQ9UL01 958 aa22.09■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa22.08■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.08■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.08■■□□□ 1.13
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HTR3CQ8WXA8 447 aa22.08■■□□□ 1.13
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TYROBPO43914 113 aa22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 INHBAP08476 426 aa22.07■■□□□ 1.12
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDK1Q15118 436 aa22.07■■□□□ 1.12
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HHATQ5VTY9 493 aa22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC44A1Q8WWI5 657 aa22.07■■□□□ 1.12
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A0A0MRY4 1105 aa22.07■■□□□ 1.12
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT4P19013 534 aa22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TAC1P20366 129 aa22.07■■□□□ 1.12
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SYPL2Q5VXT5 272 aa22.07■■□□□ 1.12
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACBD6Q9BR61 282 aa22.07■■□□□ 1.12
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RAD54BQ9Y620 910 aa22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CAPN7Q9Y6W3 813 aa22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.06■■□□□ 1.12
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP11A1P05108 521 aa22.06■■□□□ 1.12
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SCAPQ12770 1279 aa22.06■■□□□ 1.12
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTM1Q13496 603 aa22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MZB1Q8WU39 189 aa22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IRGQQ8WZA9 623 aa22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PIGVQ9NUD9 493 aa22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COX16Q9P0S2 106 aa22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SQORQ9Y6N5 450 aa22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 H0YHG0 523 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NRP1O14786 923 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TM9SF1O15321 606 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AVILO75366 819 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LTFP02788 710 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADRA1BP35368 520 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAGEA3P43357 314 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GLUD2P49448 558 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LPIN1Q14693 890 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTFR1Q15390 333 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM26DQ5JW98 314 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RNF169Q8NCN4 708 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NOD1Q9Y239 953 aa22.05■■□□□ 1.12
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