RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552211.5

NCKAP1L-208, Transcript of NCK associated protein 1 like, human

TSL 5

Gene NCKAP1L, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1L-208	ENST00000552211	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	DMAC2	Q9NW81	257 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	NAGPA	Q9UK23	515 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ATM	Q13315	3056 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211		H0Y8X5	98 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	EXOC3	O60645	756 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GABBR2	O75899	941 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	CALCA	P01258	141 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	WNT1	P04628	370 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	CD58	P19256	250 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ATIC	P31939	592 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	KIF11	P52732	1056 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PPP3CA	Q08209	521 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ZACN	Q401N2	412 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ZNF394	Q53GI3	561 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	UNC13D	Q70J99	1090 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SV2A	Q7L0J3	742 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GLRX5	Q86SX6	157 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	EHD2	Q9NZN4	543 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	KALRN	O60229	2985 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TENM4	Q6N022	2769 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PLK4	O00444	970 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SPTLC2	O15270	562 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	KIF20A	O95235	890 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	EPHX1	P07099	455 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FAM163B	P0C2L3	166 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PRR29	P0C7W0	189 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FAM200B	P0CF97	657 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HLA-F	P30511	346 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	MATK	P42679	507 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	DNAJC3	Q13217	504 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SLC14A1	Q13336	389 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PKP1	Q13835	747 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	STK38	Q15208	465 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SHB	Q15464	509 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PTPRN	Q16849	979 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SEMA4D	Q92854	862 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	CIPC	Q9C0C6	399 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	ATP8B3	O60423	1300 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GFRA2	O00451	464 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	IGLV3-19	P01714	112 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	KRT10	P13645	584 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	DPP6	P42658	865 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	GCLM	P48507	274 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	INCA1	Q0VD86	236 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SDE2	Q6IQ49	451 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	PCSK4	Q6UW60	755 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FOXJ1	Q92949	421 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	BIRC7	Q96CA5	298 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	TNIP3	Q96KP6	325 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	COMMD8	Q9NX08	183 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NCKAP1L-208	ENST00000552211	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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