RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 S100A12P80511 92 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 EFHC2Q5JST6 749 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TDHQ8IZJ6 230 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 FANCEQ9HB96 536 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 COL1A2P08123 1366 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 WRBO00258 174 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 HAT1O14929 419 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 BPNT1O95861 308 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 AGR2O95994 175 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PLS3P13797 630 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MSR1P21757 451 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CRABP2P29373 138 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ATP5OP48047 213 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GSSP48637 474 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 LHX1P48742 406 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 OSTNP61366 133 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PHC1P78364 1004 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TMPRSS15P98073 1019 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SMARCB1Q12824 385 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RIPK1Q13546 671 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SMCO1Q147U7 214 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KRT39Q6A163 491 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MND1Q9BWT6 205 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DCLK3Q9C098 648 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SETD4Q9NVD3 440 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 APPL1Q9UKG1 709 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CENPXA8MT69 81 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 H3BRB1 525 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RHOBTB3O94955 611 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SNX4O95219 450 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 IL33O95760 270 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NAMPTP43490 491 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SNAP25P60880 206 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 IL9RQ01113 521 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC58Q4VC31 144 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 BROXQ5VW32 411 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 HERVK_113Q902F9 699 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GPR20Q99678 358 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SSX3Q99909 188 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DPH5Q9H2P9 285 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 JAK2O60674 1132 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ALDH1A2O94788 518 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 HMGN1P05114 100 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ADH1AP07327 375 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KLRC2P26717 231 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ACTR2P61160 394 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NAA20P61599 178 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 LPIN1Q14693 890 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NECTIN1Q15223 517 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ANO4Q32M45 955 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ADSSL1Q8N142 457 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TBATAQ96M53 351 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PXMP2Q9NR77 195 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms