RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRB-209ENST00000550857 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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PTPRB-209ENST00000550857 THEGQ9P2T0 379 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 CTIFO43310 598 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRB-209ENST00000550857 MED24O75448 989 aa8.28□□□□□ -1.08
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