RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PRU2 124 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 COCHO43405 550 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 GLP2RO95838 553 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CKMP06732 381 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 FOSL2P15408 326 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ADRA1BP35368 520 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 HCAR3P49019 387 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SLC11A2P49281 568 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 HDAC4P56524 1084 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 OGDHQ02218 1023 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 NME3Q13232 169 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ADGRE1Q14246 886 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CDO1Q16878 200 aa9.68□□□□□ -0.86
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CS-220ENST00000550700 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TAC4Q86UU9 113 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 DEFB123Q8N688 67 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 EXD1Q8NHP7 514 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 MAIP1Q8WWC4 291 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 OTUB2Q96DC9 234 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SLC39A13Q96H72 371 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 LRCH3Q96II8 777 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 OSBPL2Q9H1P3 480 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CARD9Q9H257 536 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ZWILCHQ9H900 591 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 OSER1Q9NX31 292 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 OBP2AQ9NY56 170 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CLEC1BQ9P126 229 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 STIM2Q9P246 746 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CD207Q9UJ71 328 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 NOTCH4Q99466 2003 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SLC12A8A0AV02 714 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 E2F8A0AVK6 867 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 KCNU1A8MYU2 1149 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
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CS-220ENST00000550700 IGLV3-27P01718 113 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TNNT1P13805 278 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 L1CAMP32004 1257 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TXNDC8Q6A555 127 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 TRNP1Q6NT89 227 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 LRRC31Q6UY01 552 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 OTOP3Q7RTS5 596 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 MIB1Q86YT6 1006 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 SLC35F6Q8N357 371 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 MAB21L3Q8N8X9 362 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 KCTD6Q8NC69 237 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 CD101Q93033 1021 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 BTBD6Q96KE9 485 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
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CS-220ENST00000550700 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
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CS-220ENST00000550700 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-220ENST00000550700 C2orf78A6NCI8 922 aa9.66□□□□□ -0.86
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