RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	MATN1	P21941	496 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	KLRK1	P26718	216 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	BLMH	Q13867	455 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CNGA3	Q16281	694 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC38	Q502W7	563 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	KAZALD1	Q96I82	304 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	WIPF3	A6NGB9	483 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	DHH	O43323	396 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CER1	O95813	267 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CERS1	P27544	350 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	DUSP1	P28562	367 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	MPG	P29372	298 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	C21orf58	P58505	322 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	SLC14A1	Q13336	389 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ACSM6	Q6P461	480 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	RMDN3	Q96TC7	470 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	DACT1	Q9NYF0	836 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	OVOL3	O00110	214 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	SYT5	O00445	386 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	TRIM38	O00635	465 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	TUBB4A	P04350	444 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ITGA2B	P08514	1039 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	GYS1	P13807	737 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	SERPINF1	P36955	418 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	VPS41	P49754	854 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	FOXF2	Q12947	444 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CEP78	Q5JTW2	689 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC174	Q6PII3	467 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	TRABD2A	Q86V40	505 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	FAR2	Q96K12	515 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	NUAK2	Q9H093	628 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	NFU1	Q9UMS0	254 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125		M0QZQ0	153 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	PPP6C	O00743	305 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	LATS1	O95835	1130 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	THBS4	P35443	961 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	CHKA	P35790	457 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	TRAPPC10	P48553	1259 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	POLE2	P56282	527 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	KRT72	Q14CN4	511 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	C16orf89	Q6UX73	402 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	GLMP	Q8WWB7	406 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	EID2B	Q96D98	161 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MDM2-231	ENST00000544125	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		5.15	□□□□□ -1.59

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