RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	GPD1	P21695	349 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MTTP	P55157	894 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	EPGN	Q6UW88	154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	C4orf22	Q6V702	233 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TBCB	Q99426	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PEX10	O60683	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MT-ND3	P03897	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PRKCB	P05771	671 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GJB1	P08034	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CXCL8	P10145	99 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CNTF	P26441	200 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GJC1	P36383	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CDK7	P50613	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	XIAP	P98170	497 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	APOF	Q13790	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	INSC	Q1MX18	579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	XKR4	Q5GH76	650 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	BICD1	Q96G01	975 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MMP19	Q99542	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897		H0Y3Z8	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	VILL	O15195	856 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GYG2	O15488	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MED7	O43513	233 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SIN3B	O75182	1162 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CETN2	P41208	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DPP6	P42658	865 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GLUD2	P49448	558 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DYNLT1	P63172	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	LSAMP	Q13449	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MTM1	Q13496	603 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NAB1	Q13506	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DPYS	Q14117	519 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	STXBP2	Q15833	593 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF394	Q53GI3	561 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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