RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A1W2PQD8 194 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNJ18B7U540 433 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 CD6P30203 668 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 CHKAP35790 457 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 RABEPKQ7Z6M1 372 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF276Q8N554 614 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 FBXL13Q8NEE6 735 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 GPR174Q9BXC1 333 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ULBP1Q9BZM6 244 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 DCLK3Q9C098 648 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 DNAI2Q9GZS0 605 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 TSPAN3O60637 253 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF202O95125 648 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 GTF2H1P32780 548 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 TKTL1P51854 596 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 DDI1Q8WTU0 396 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 CIPCQ9C0C6 399 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 STRIP2Q9ULQ0 834 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 MEI4A8MW99 385 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 UPK3BL1B0FP48 263 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 UPK3BL2E5RIL1 263 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 SH3BP5O60239 455 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 SYPP08247 313 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ENPEPQ07075 957 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF234Q14588 700 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 CBWD6Q4V339 395 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB41Q5JT25 222 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 CBWD3Q5JTY5 395 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 CBWD5Q5RIA9 395 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 SYCP2LQ5T4T6 812 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 TCERG1LQ5VWI1 586 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM215Q68D42 235 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGAP17Q68EM7 881 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 TMPRSS6Q8IU80 811 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ANKRD52Q8NB46 1076 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 CYBBP04839 570 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 EPB41P11171 864 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 PRKCHP24723 683 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 PDE4CQ08493 712 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 PNOCQ13519 176 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 UBA3Q8TBC4 463 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 UCMAQ8WVF2 138 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 EDEM1Q92611 657 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 FOXJ1Q92949 421 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ITM2CQ9NQX7 267 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ELOVL2Q9NXB9 296 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 CKAP5Q14008 2032 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 CETN3O15182 167 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ZBED1O96006 694 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 NCAM1P13591 858 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 HLA-EP13747 358 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 NUMA1Q14980 2115 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 EDRF1Q3B7T1 1238 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR45BQ5MNZ6 344 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 BHLHA9Q7RTU4 235 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM124AQ86V42 546 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 FMNL3Q8IVF7 1028 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGAP18Q8N392 663 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 SIPA1Q96FS4 1042 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 TSPAN16Q9UKR8 245 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ZZEF1O43149 2961 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A1W2PQ27 194 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A1W2PQ64 194 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 EPHX1P07099 455 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 GNSP15586 552 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 TPMTP51580 245 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 COPAP53621 1224 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 LRMPQ12912 555 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 GRIK2Q13002 908 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 ENPP2Q13822 863 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 DCAF12L1Q5VU92 463 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 CPXM2Q8N436 756 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF366Q8N895 744 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 SUSD2Q9UGT4 822 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 MSRB2Q9Y3D2 182 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 CACNA1GO43497 2377 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 GJB3O75712 270 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 CD19P15391 556 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 PRCPP42785 496 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC8A3P57103 927 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRJ-205ENST00000527952 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms