RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 CALCOCO2Q13137 446 aa8.74□□□□□ -1.01
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TRPS1-209ENST00000519674 CADM3Q8N126 398 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.74□□□□□ -1.01
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TRPS1-209ENST00000519674 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
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TRPS1-209ENST00000519674 ICMTO60725 284 aa8.74□□□□□ -1.01
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TRPS1-209ENST00000519674 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.74□□□□□ -1.01
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TRPS1-209ENST00000519674 UGT1A8Q9HAW9 530 aa8.74□□□□□ -1.01
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TRPS1-209ENST00000519674 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM132BQ14DG7 1078 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC58Q4VC31 144 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 REPS2Q8NFH8 660 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 SLC20A1Q8WUM9 679 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 ATL1Q8WXF7 558 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 HSPH1Q92598 858 aa8.73□□□□□ -1.01
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