RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 PCDHB18PQ96TA0 734 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 AGPAT1Q99943 283 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 SYT15Q9BQS2 421 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 MED10Q9BTT4 135 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 DNAI2Q9GZS0 605 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 PDCL3Q9H2J4 239 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 RXFP1Q9HBX9 757 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 CRTAC1Q9NQ79 661 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 KRT82Q9NSB4 513 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMLHEQ9NVH6 421 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 HMGXB4Q9UGU5 601 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 IP6K2Q9UHH9 426 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDH9Q9ULB4 789 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 MYO6Q9UM54 1294 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 RWDD3Q9Y3V2 267 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 BACE2Q9Y5Z0 518 aa5.65□□□□□ -1.5
MSC-AS1-205ENST00000519068 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SCN1AP35498 2009 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 EPOPA6NHQ4 379 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR6C75A6NL08 312 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 HIDE1A8MVS5 230 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 C5orf67F2Z3F1 127 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PER2O15055 1255 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 TEX28O15482 410 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 LPXNO60711 386 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 TCEA3O75764 348 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MMEP08473 750 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CNPP09543 421 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 JMJD7P0C870 316 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CTSAP10619 480 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC130P13994 396 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CYP2F1P24903 491 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLRC2P26717 231 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PCSK1P29120 753 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADORA2BP29275 332 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAN1A1P33908 653 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 GLUD2P49448 558 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SCNN1BP51168 640 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 NEK3P51956 506 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF132P52740 706 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 GSDMDP57764 484 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 TSPY1Q01534 308 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CYP27A1Q02318 531 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 UBE3AQ05086 875 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 INCA1Q0VD86 236 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC173Q0VFZ6 552 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAPQ12884 760 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 DUSP4Q13115 394 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPR17Q13304 367 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 GBX1Q14549 363 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF460Q14592 562 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 INPP5AQ14642 412 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTPN14Q15678 1187 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PSMD5Q16401 504 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC142Q17RM4 750 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 LRIT3Q3SXY7 679 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC39A12Q504Y0 691 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SGO2Q562F6 1265 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ERAP2Q6P179 960 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 DENND1BQ6P3S1 775 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CYP26C1Q6V0L0 522 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 KIF18BQ86Y91 864 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMTC1Q8IUR5 882 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ANKRD52Q8NB46 1076 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 LRRN4CLQ8ND94 238 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPATA18Q8TC71 538 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC2A14Q8TDB8 520 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 USP33Q8TEY7 942 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CPA5Q8WXQ8 436 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 TTC17Q96AE7 1141 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC42Q96M95 316 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PGLYRP2Q96PD5 576 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PANX2Q96RD6 677 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC30A3Q99726 388 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 TCF25Q9BQ70 676 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ORAI3Q9BRQ5 295 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms