RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518141.1

CPEB4-204, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, human

TSL 3

Gene CPEB4, Length 429 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB4-204	ENST00000518141		F8W810	466 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	KCNQ3	O43525	872 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	COQ9	O75208	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	TFEB	P19484	476 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	MMP8	P22894	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	SLC5A2	P31639	672 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ATIC	P31939	592 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	HOXD12	P35452	270 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	PBX1	P40424	430 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	GPS1	Q13098	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	SGPL1	O95470	568 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	AR	P10275	920 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	IDUA	P35475	653 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	MTA1	Q13330	715 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	GALE	Q14376	348 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	PMM1	Q92871	262 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	GJA10	Q969M2	543 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141		A0A087WZ62	844 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	PRY	O14603	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	FGF2	P09038	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	MYL4	P12829	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	IDE	P14735	1019 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	VPS41	P49754	854 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	HTR6	P50406	440 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	KAT2B	Q92831	832 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	DRD1	P21728	446 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	YY1	P25490	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	MST1	P26927	711 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	NDUFS1	P28331	727 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ZNF84	P51523	738 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPEB4-204	ENST00000518141	GPR162	Q16538	588 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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