RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PGDP52209 483 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC12A2P55011 1212 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EVA1CP58658 441 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ITKQ08881 620 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAF3Q13114 568 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPS2Q13227 327 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNASE1L3Q13609 305 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C6orf10Q5SRN2 563 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DENND2CQ68D51 928 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDXDC1Q6P996 788 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GIMAP6Q6P9H5 292 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMIM29Q86T20 159 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDIASQ8IXT1 998 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADGRF4Q8IZF3 695 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MPP5Q8N3R9 675 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPEM1Q8N4L4 309 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C7orf57Q8NEG2 295 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM174Q8WUU8 243 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GFRA4Q9GZZ7 299 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAGEH1Q9H213 219 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL21RQ9HBE5 538 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLAC1Q9HBJ0 212 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABHD10Q9NUJ1 306 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASNSD1Q9NWL6 643 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCN5AQ14524 2016 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A088AWK7 358 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BTBD18B2RXH4 712 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 I6L893 689 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYO1CO00159 1063 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBX3O15119 743 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MDM4O15151 490 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DTNBO60941 627 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CBFA2T3O75081 653 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BAG4O95429 457 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOXC6P09630 235 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CFC1BP0CG36 223 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CFC1P0CG37 223 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KITP10721 976 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TFEBP19484 476 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFS1P28331 727 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRKAR1BP31321 381 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VPS41P49754 854 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MTHFSP49914 203 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GUCY2FP51841 1108 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC13A2Q13183 592 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNAB1Q14722 419 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DLGAP5Q15398 846 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WASHC2DQ5SRD0 308 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM63BQ5T3F8 832 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SDE2Q6IQ49 451 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPSB3Q6PJ21 355 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF783Q6ZMS7 281 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RHPN2Q8IUC4 686 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP1R35Q8TAP8 253 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LPAR1Q92633 364 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KAT2AQ92830 837 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HPS3Q969F9 1004 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GJA10Q969M2 543 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SELENOOQ9BVL4 669 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TM6SF1Q9BZW5 370 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCLK3Q9C098 648 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLK2Q9NYY3 685 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GABBR1Q9UBS5 961 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VPS4AQ9UN37 437 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USP19O94966 1318 aa1.19□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TLDC2A0PJX2 215 aa1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms