RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514402.1

MATR3-223, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-223	ENST00000514402	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	RASA4B	C9J798	803 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	APAF1	O14727	1248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	RASA4	O43374	803 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	PLAU	P00749	431 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	KCNAB3	O43448	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	GLP2R	O95838	553 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	DRD1	P21728	446 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	TNFSF4	P23510	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	HOXD12	P35452	270 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	GSTM5	P46439	218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	STIM1	Q13586	685 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ADAM10	O14672	748 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	RRH	O14718	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	SGPL1	O95470	568 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	MYL1	P05976	194 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PRF1	P14222	555 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ITGB6	P18564	788 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	AK2	P54819	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	YPEL5	P62699	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	BFSP2	Q13515	415 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	CBFB	Q13951	182 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	MYMK	A6NI61	221 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PRY	O14603	147 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	DHH	O43323	396 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	NDST3	O95803	873 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	TFEB	P19484	476 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	YY1	P25490	414 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	NDUFS1	P28331	727 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	CSHL1	Q14406	222 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PIGK	Q92643	395 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	GJA10	Q969M2	543 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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