RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CYP4F3	Q08477	520 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	RALGDS	Q12967	914 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	STRN3	Q13033	797 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SPP2	Q13103	211 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC14A1	Q13336	389 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CUL3	Q13618	768 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ACAP2	Q15057	778 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	IL17A	Q16552	155 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CAMK4	Q16566	473 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	STX1A	Q16623	288 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	BORA	Q6PGQ7	559 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	LDHD	Q86WU2	507 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ERO1B	Q86YB8	467 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR49	Q8IV35	697 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CNTD1	Q8N815	330 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CNNM3	Q8NE01	707 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ELOA3	Q8NG57	546 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CEP76	Q8TAP6	659 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SPATA20	Q8TB22	786 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CALML6	Q8TD86	181 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR24	Q96S15	920 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ANO3	Q9BYT9	981 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CUEDC2	Q9H467	287 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	C12orf10	Q9HB07	376 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	HESX1	Q9UBX0	185 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	VPS28	Q9UK41	221 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PARP14	Q460N5	1801 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF536	O15090	1300 aa		7.02	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC12A8	A0AV02	714 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971		A6NLC8	198 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971		K7EPI3	171 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CXCL11	O14625	94 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	GIPC1	O14908	333 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PER2	O15055	1255 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SCAMP1	O15126	338 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR182	O15218	404 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SMPD2	O60906	423 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SMIM24	O75264	130 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TOMM70	O94826	608 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC166	P0CW27	439 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CDK4	P11802	303 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	MC4R	P32245	332 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	STAT5A	P42229	794 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	DIO1	P49895	249 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	HSD17B4	P51659	736 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	GSDMD	P57764	484 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PPAT	Q06203	517 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	DNAJC3	Q13217	504 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RIPK1	Q13546	671 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PWP1	Q13610	501 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	BLMH	Q13867	455 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	STAT4	Q14765	748 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CASP8	Q14790	479 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ODF1	Q14990	250 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CRY1	Q16526	586 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	AAK1	Q2M2I8	961 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FYB2	Q5VWT5	728 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	AAGAB	Q6PD74	315 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RFX8	Q6ZV50	586 aa		7.02	□□□□□ -1.29

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