RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495679.5

DPPA4-208, Transcript of developmental pluripotency associated 4, human

TSL 4

Gene DPPA4, Length 805 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DPPA4-208	ENST00000495679	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	APOE	P02649	317 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	KLKB1	P03952	638 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	UCHL3	P15374	230 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	TNFRSF4	P43489	277 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	SLC11A2	P49281	568 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	TBX4	P57082	545 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	ARID5A	Q03989	594 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	MESP2	Q0VG99	397 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	TAF3	Q5VWG9	929 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	SDE2	Q6IQ49	451 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	ANO7	Q6IWH7	933 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	PGBD3	Q8N328	593 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	ADAM32	Q8TC27	787 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	SPAG5	Q96R06	1193 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	FAM170A	A1A519	330 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679		F8VZ95	297 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	TRIM24	O15164	1050 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	LATS1	O95835	1130 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	HOXC13	P31276	330 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	GBP1	P32455	592 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	WAS	P42768	502 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	KLK7	P49862	253 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	ZNF445	P59923	1031 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	MPPE1	Q53F39	396 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	CHPF	Q8IZ52	775 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	CPXM2	Q8N436	756 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	NEK11	Q8NG66	645 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	STK32A	Q8WU08	396 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	UCMA	Q8WVF2	138 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	RNF34	Q969K3	372 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	COX16	Q9P0S2	106 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	USP18	Q9UMW8	372 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	ANTXRL	A6NF34	631 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	SMTNL1	A8MU46	457 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	SGK1	O00141	431 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	GABBR2	O75899	941 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	GFPT2	O94808	682 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	HOXB2	P14652	356 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	CYP11B1	P15538	503 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	PTMS	P20962	102 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	HOXA6	P31267	233 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	CLCN1	P35523	988 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	UBXN1	Q04323	297 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	SYCP1	Q15431	976 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	CRY1	Q16526	586 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	DCAF6	Q58WW2	860 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	EMC10	Q5UCC4	262 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	FYB2	Q5VWT5	728 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	TAC4	Q86UU9	113 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DPPA4-208	ENST00000495679	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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