RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 CNTN3Q9P232 1028 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHD1O14646 1710 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 LAMB2P55268 1798 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC22A1O15245 554 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZW10O43264 779 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 BANF1O75531 89 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLPXO76031 633 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRB10Q13322 594 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNTA1Q13424 505 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 SV2BQ7L1I2 683 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 HERVK_113Q902F9 699 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC5A5Q92911 643 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 NGLY1Q96IV0 654 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 TXNDC15Q96J42 360 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 RILPQ96NA2 401 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 OSBPL11Q9BXB4 747 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 NYXQ9GZU5 481 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 WWP1Q9H0M0 922 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAGEE1Q9HCI5 957 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 HDAC9Q9UKV0 1011 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A0B4J269 797 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACOX3O15254 700 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 NDUFS2O75306 463 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 GCATO75600 419 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 IL1BP01584 269 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 CAPN1P07384 714 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 TECP42680 631 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 PHKA1P46020 1223 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 HK2P52789 917 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 COPAP53621 1224 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 TUBB3Q13509 450 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPP2R5DQ14738 602 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 MGAT5BQ3V5L5 792 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLX4IPQ5VYV7 408 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 HERC6Q8IVU3 1022 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 BLIDQ8IZY5 108 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC33Q8N5R6 958 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 CATSPER1Q8NEC5 780 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF347Q96SE7 839 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 C1orf50Q9BV19 199 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAU2Q9Y6X3 613 aa7.1□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 GOLGA8JA6NMD2 632 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 GSG1L2A8MUP6 293 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 FSCN2O14926 492 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPC4O75487 556 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 CD1EP15812 388 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARNTP27540 789 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 TBCCQ15814 346 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC142Q17RM4 750 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT80Q6KB66 452 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANKLE2Q86XL3 938 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM126BQ8IUX1 230 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 TERB1Q8NA31 727 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNIP2Q8NFZ5 429 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF597Q96LX8 424 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 PNMA5Q96PV4 448 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 GIMAP4Q9NUV9 329 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 PARVAQ9NVD7 372 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 AP4S1Q9Y587 144 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A087WXM4 84 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 M0R2N6 131 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF254O75437 659 aa7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT5P13647 590 aa7.09□□□□□ -1.27
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