RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 CXCL17Q6UXB2 119 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 STX19Q8N4C7 294 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PPP3CAQ08209 521 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 STARD3Q14849 445 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 DEFB115Q30KQ5 88 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 WDR59Q6PJI9 974 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CLEC4FQ8N1N0 589 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 TRPM4Q8TD43 1214 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 DACH2Q96NX9 599 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 APOL2Q9BQE5 337 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ATXN3LQ9H3M9 355 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 O00370 1275 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 TPBGLP0DKB5 382 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 MIPP30301 263 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 RPL9P32969 192 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SPANXN3Q5MJ09 141 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PPM1LQ5SGD2 360 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 COPS5Q92905 334 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 RMND5AQ9H871 391 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CDH9Q9ULB4 789 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SOX13Q9UN79 622 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SIGLEC16A6NMB1 481 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 GRTP1Q5TC63 336 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 DYRK1BQ9Y463 629 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 E5RJQ4 531 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PGAM1P18669 254 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CD151P48509 253 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 LRRC8BQ6P9F7 803 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 LENG9Q96B70 501 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ECSITQ9BQ95 431 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 KLRC4O43908 158 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D4O60343 1298 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PYGMP11217 842 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PRKAA2P54646 552 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 NAB1Q13506 487 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 FLOT2Q14254 428 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 LRRC38Q5VT99 294 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CCDC33Q8N5R6 958 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 EPS8L1Q8TE68 723 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 WNT8BQ93098 351 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 TLR10Q9BXR5 811 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 COL1A2P08123 1366 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CPA3P15088 417 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 GRK3P35626 688 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CAPSQ13938 189 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 BMT2Q1RMZ1 405 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 MFSD7Q6UXD7 560 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CCDC149Q6ZUS6 474 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 APPL1Q9UKG1 709 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 GLI1P08151 1106 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 AMPD1P23109 780 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 BDNFP23560 247 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 GP5P40197 560 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PSEN1P49768 467 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 NCKAP1LP55160 1127 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SPDYCQ5MJ68 293 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 USP20Q9Y2K6 914 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ASTN1O14525 1302 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 LOC100653049A0A140TA62 436 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CAND2O75155 1236 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 KRT34O76011 436 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ENDOD1O94919 500 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 IGSF6O95976 241 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ITGB5P18084 799 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 HYIQ5T013 277 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SEL1L3Q68CR1 1132 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 DSG4Q86SJ6 1040 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PGLYRP2Q96PD5 576 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ULBP1Q9BZM6 244 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CDT1Q9H211 546 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SOAT1P35610 550 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SCNN1GP51170 649 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 LPCAT1Q8NF37 534 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 EFCAB1Q9HAE3 211 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CCDC130P13994 396 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CNTN1Q12860 1018 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 DTX3LQ8TDB6 740 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 LRRC39Q96DD0 335 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ZNF558Q96NG5 402 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CASZ1Q86V15 1759 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ROBO3Q96MS0 1386 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP17.48■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 137.9
NISCH-213ENST00000489895 TRIM16O95361 564 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PDPK2PQ6A1A2 396 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 LRRC55Q6ZSA7 311 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 LGI2Q8N0V4 545 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 KCND1Q9NSA2 647 aa17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms