RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 EPN3Q9H201 632 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 CDT1Q9H211 546 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 GDE1Q9NZC3 331 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 GDAQ9Y2T3 454 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 R4GN57 208 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 F5P12259 2224 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR27A2RRH5 827 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 E9PMD0 336 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 TRAPPC3O43617 180 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 HIP1RO75146 1068 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ECI2O75521 394 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 CPP00450 1065 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 NTRK1P04629 796 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 RHOP08100 348 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 INHBBP09529 407 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 MCF2P10911 925 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ATF2P15336 505 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 FCARP24071 287 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 PRPHP41219 470 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 BRCC3P46736 316 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ID4P47928 161 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNAB2Q13303 367 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC9A5Q14940 896 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 DDR2Q16832 855 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF528Q3MIS6 628 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 GLRA4Q5JXX5 417 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 SPECC1Q5M775 1068 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 HYIQ5T013 277 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC83Q8IWF9 413 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 DIO2Q92813 273 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC140Q96MF4 163 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 RNF38Q9H0F5 515 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 DNM3Q9UQ16 869 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC169A6NNP5 214 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 PP2D1A8MPX8 630 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 C22orf46C9J442 243 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 I3L4J1 428 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 LAD1O00515 517 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 PODXLO00592 558 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 SYN3O14994 580 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 MOSPD3O75425 235 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 SEC24AO95486 1093 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 NCAM1P13591 858 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 PTPN2P17706 415 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 PMLP29590 882 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 CDC25AP30304 524 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 CCR2P41597 374 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGEA9P43362 315 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 RPS9P46781 194 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 EPHA5P54756 1037 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 PEX3P56589 373 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 PFKPQ01813 784 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ROR1Q01973 937 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 CYP4F3Q08477 520 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ZBTB6Q15916 424 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 TPGS2Q68CL5 300 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 BEST2Q8NFU1 509 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 RMDN1Q96DB5 314 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ACAP3Q96P50 834 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 NELL2Q99435 816 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 TIPINQ9BVW5 301 aa6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms