RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 NFU1Q9UMS0 254 aa5.12□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa5.12□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 WDR17Q8IZU2 1322 aa5.12□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 GXYLT2A0PJZ3 443 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 PCDH17O14917 1159 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 DSCR3O14972 297 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 NPC1O15118 1278 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 CTIFO43310 598 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 DHHO43323 396 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 ANXA6P08133 673 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 ICA1Q05084 483 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 SPARCL1Q14515 664 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 CEP78Q5JTW2 689 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 ANO7Q6IWH7 933 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 NEK8Q86SG6 692 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 FAM71BQ8TC56 605 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 GLMPQ8WWB7 406 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 VOPP1Q96AW1 172 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 FAR2Q96K12 515 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 PAAF1Q9BRP4 392 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 CRB3Q9BUF7 120 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 EPS8L2Q9H6S3 715 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 SEMA5BQ9P283 1151 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 TAGLN3Q9UI15 199 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 VPS4AQ9UN37 437 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 PCSK5Q92824 1860 aa5.11□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 CGB1A6NKQ9 187 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 F5H423 210 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 ASNA1O43681 348 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 USP12O75317 370 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 TAF5LO75529 589 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 ITGA5P08648 1049 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 TACR3P29371 465 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 MPGP29372 298 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 POLE2P56282 527 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 SLC14A1Q13336 389 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 BIRC2Q13490 618 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 PTK2BQ14289 1009 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 AWAT1Q58HT5 328 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 ACSM6Q6P461 480 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 RSC1A1Q92681 617 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 NUAK2Q9H093 628 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 WDR26Q9H7D7 661 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 ARL8BQ9NVJ2 186 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 COMMD10Q9Y6G5 202 aa5.1□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 PRR35P0CG20 571 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 CDK4P11802 303 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 KELP23276 732 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 ABCG1P45844 678 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 ELF2Q15723 593 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 FAM110CQ1W6H9 321 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 ZACNQ401N2 412 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 RINT1Q6NUQ1 792 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 GGT6Q6P531 493 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 EID2BQ96D98 161 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 RPS6KC1Q96S38 1066 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 SENP7Q9BQF6 1050 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 CDCP1Q9H5V8 836 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 KCNK9Q9NPC2 374 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 PDGFCQ9NRA1 345 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 PI4KBQ9UBF8 816 aa5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTEN-204ENST00000487939 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 AQP12BA6NM10 295 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 LGALS16A8MUM7 142 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 SYT5O00445 386 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 ITGA2BP08514 1039 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 ALADP13716 330 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 NDUFS1P28331 727 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 AKT1P31749 480 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 SLC8A1P32418 973 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 VPS41P49754 854 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 HSF1Q00613 529 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 GHRHRQ02643 423 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 BLMHQ13867 455 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 GRM4Q14833 912 aa5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTEN-204ENST00000487939 PFKFB4Q16877 469 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms